溫病學派是吳門最具地方特色和科技優勢的一大流派，從某種意義上講是吳門醫派主流。明清時期達鼎盛階段，並在相當長的時期內，居世界科技領先的地位。
溫病學派的特色表現在如下幾個方面：
1、在治療外感病方面逐步擺脫傷寒學說的羈絆而形成的一大學派。
2、溫病家有強烈的崇實創新精神。通常被稱爲"時醫"， 處方用藥以"輕、清、靈、巧"見長。
3、以衛氣營血辨證論治典型的溫病。以逆傳心包、溼溫、伏氣溫病理論治療非典型溫病。
4、重視預防及潛伏期和初期治療，病程中注意存津救液、保護元神。
5、驗齒察舌、辨斑疹白瘖等陽性體證檢查被普遍採用，提高了中醫診斷水平。
溫病學派對後世中醫學的發展產生了極爲重要的影響和貢獻，主要表現在以下幾個方面：
完善了中醫學的理論
溫病學派將溫病從傷寒中獨立出來，糾正了前人的錯誤，補充了前人在理論上的空白，使溫病的治療擺脫了《傷寒論》的束縛，在臨牀上也取得了十分顯著的效果。
初步建立了中醫傳染病學
吳有性創造性地提出“戾氣”通過口鼻侵犯人體，使人感染瘟疫，科學地預見了傳染病的主要傳播途徑是從“口鼻而入”。這些都爲傳染病學的防治提供了理論基礎和實踐指導，使中醫傳染病學得到了初步的建立。
對傳統辨證論治的補充
溫病辨證論治的綱領衛氣營血辨證補充了傳統的“六經辨證”或“八綱辯證”的內容，爲中醫診斷學的發展做出了突出的貢獻。
注重實踐的傳統
溫病學派醫家注重實踐，敢於突破創新的精神也深深地影響了後世中醫的發展。
綜上所述，溫病學派作爲中國醫學史上一個重要的學術流派，它完善了中醫基礎理論，同時也開創了中醫傳染病學的先河，爲中醫學的發展做出了突出的貢獻。
