文宗閣版
文宗閣位於鎮江金山寺。文匯閣一名御書樓，位於揚州天寧寺西園大觀堂。乾隆四十二年(1777)兩淮鹽政寅著領到頒貯揚州天寧寺行宮和鎮江金山行宮的兩部《古今圖書集成》，奏請在行宮內仿天一閣規模建造藏書樓。乾隆四十四年(1779)鎮江藏書閣建成，乾隆賜名文宗閣。次年揚州藏書閣建成，賜名文匯閣。兩閣各入藏《古今圖書集成》一部，閣中尚多空餘書閣，後各收貯《四庫全書》。道光二年(1842)第一次鴉片戰爭中，文宗閣本《四庫全書》遭英軍破壞。太平天國勢力發展到江浙時，鎮江、揚州被太平軍攻克，文宗閣、文匯閣及其所貯《四庫全書》一同化爲灰燼。
文瀾閣版
杭州聖因寺行宮原有《古今圖書集成》藏書堂一處，乾隆四十七年(1782)在堂後改建文瀾閣，次年年底完工。咸豐十一年(1861)太平軍第二次攻下杭州，文瀾閣《四庫全書》大量散佚。杭州藏書家丁申丁丙兄弟收集殘餘，得到8140冊，僅及原書四分之一。1864年太平軍退走，丁氏兄弟又不惜重金從民間收購。光緒六年(1880)在舊閣原址上重建文瀾閣。丁氏兄弟將書送還，並陸續抄補。民國後，歸浙江省圖書館庋藏。1914年、1923年，兩次組織人力就丁氏兄弟鈔補未全者予以補鈔。文瀾閣本《四庫全書》始漸復其原。抗戰時曾運至青木關，勝利後運回浙江，現藏浙江省圖書館。
文津閣版
在熱河行宮(今河北省承德市)的避暑山莊。乾隆三十九年(1774)，開始修建文津閣，次年修建完畢。乾隆四十九年十一月(1784)，《四庫全書》入藏。1913年，文津閣本《四庫全書》由國民政府運歸北京，藏於文華殿古物陳列所。1915年，撥交新成立的京師圖書館(今國家圖書館前身)，成爲國家圖書館鎮館之寶。每冊卷首有“文津閣寶”，末頁有“避暑山莊”、“太上皇帝之寶”小篆朱文方璽各一。史部的《八旗通志》成於嘉慶初年，後再補入，故里面僅有“嘉慶御覽之寶”一方。全書與通行印本《四庫全書目錄》微有不同，蓋以抄寫較晚，有修訂改易之處
文源閣版
在圓明園內。園中“水木明瑟”之北稍西爲文源閣，上下各六楹，閣西爲“柳浪聞鶯”。文源閣的匾額及閣內汲古觀瀾匾額都是乾隆皇帝御書。文源閣前爲玲瓏峯，上面刊有乾隆御製《文源閣詩》閣東的亭內有石碑，上刊御製《文源閣記》。文源閣本《四庫全書》在乾隆四十八年(1783)抄畢入藏。咸豐十年(1860)，英法聯軍入侵，大肆焚掠圓明園，文源閣本《四庫全書》化爲灰燼。今天，文源閣遺址已不可尋。刻《文源閣記》石碑尚存世間。
文溯閣版
在遼寧瀋陽故宮內。乾隆四十七年(1782)，第二部《四庫全書》抄寫完畢，送藏文溯閣。民國時期，文溯閣《四庫全書》輾轉流徙，幾經危殆。1914年運京，存於保和殿。1925年，奉天教育人士擬辦圖書館，呈請北京國民政府當局索回此書。1931年“九一八”事變爆發，東北淪陷，文溯閣本《四庫全書》也落入日本人手中。日方曾假借所謂“國立圖書館”的名義代爲封存。1945年日本戰敗投降，文溯閣本《四庫全書》才又回到人民手中。文化大革命期間，因戰備需要，中央下令將文溯閣本《四庫全書》從瀋陽調出，運至甘肅存放至今。
位於紫禁城內的主敬殿後(主敬殿爲文華殿後殿)，建成於乾隆四十一年(1776)。乾隆四十六年十二月(1782)，第一部《四庫全書》繕寫告成，入藏閣內。民國時期，由故宮博物院接管。1933年春天，日寇侵略熱河，北平地區形勢十分危急。故宮博物院將文淵閣本《四庫全書》連同所藏其他歷代文物裝箱南遷，運至上海。抗日戰爭全面爆發，又輾轉數千裏運抵蜀中。抗戰勝利之後復運抵南京。國民黨政府從大陸撤退時，運往臺灣，現藏臺北故宮博物院。
文津閣版
現存於國家圖書館的文津閣《四庫全書》，是七部《四庫全書》中的第四部，成書於清乾隆四十九年(1784)，原存於承德避暑山莊。文津閣《四庫全書》入藏國家圖書館後，一直受到人們的特別關注，與敦煌遺書、《趙城金藏》和《永樂大典》並稱爲國家圖書館善本四大專藏。
文津閣《四庫全書》共36304冊，分裝6144個書函，陳列擺放在128個書架上。它是七部《四庫全書》中保存最爲完整，並且至今仍是原架、原涵、原書一體、乾隆御筆“題舊五代史八韻”刻在子部第32、33架的側板上。書函中央板、絲帶、銅環一依當年。翻開書冊，即見“文津閣寶”朱印、“紀昀復勘”黃箋、雪白的開化紙和端正的館閣體楷書，令人歎爲觀止。
文津閣《四庫全書》具有獨特的歷史文獻價值
第一， 從七部《四庫全書》的成書時間來看，文津閣是北方四閣中最後完成的一部，距第一部文淵閣《四庫全書》成書已有三年之久，對已發現的訛誤、遺漏當有所補正。
第二， 文津閣本是檔案明確記載曾經乾隆親校，並由紀昀親自三校的抄本，幾乎每冊均有校覈記錄，其編校質量優於包括文淵閣本在內的其他諸本。
第三， 就僅存的三部半《四庫全書》看，文津閣本保存最爲完整，其他三閣本均分別據文津閣本加以補抄。經學者覈對錄異，文津閣本《四庫全書》與文津閣本在篇卷、文字、《永樂大典》輯佚本、序跋、附錄、提要等方面存在很多差異。文津閣《四庫全書》所保存下來的一些文獻資料已是海內孤篇。
