藍玉案發生在洪武二十六年(1393年)，是明太祖朱元璋藉口涼國公藍玉謀反，株連殺戮功臣宿將的重大政治案件。朱元璋借藍玉案徹底剷除了將權對君權的潛在威脅，將軍權牢牢地控制在自己手中。
洪武二十六年(1393年)，朱元璋以謀反的罪名誅殺了大將軍藍玉，而藍玉是洪武時期的主要將領之一。洪武二十一年(1388年)，他率15萬大軍出塞追擊蒙古軍隊，直到捕魚兒海(即今貝爾湖)，俘獲男女七萬七千人，大勝而歸。此後，他又多次北征蒙古，立下赫赫戰功，被晉封爲涼國公，位居大將軍之職。藍玉統兵多年，在軍中頗有威望;麾下驍將十餘員，個個勇猛善戰。以一介武夫起家的朱元璋，原本就最忌武人擁兵;而藍玉卻自恃功高勢大，驕橫不法。在軍中，他擅自黜陟將校，進止自專，甚至不聽君命。某次北征還師，夜扣喜峯關，關吏沒有及時接納，藍玉就縱兵毀關強行進入，這一舉動顯然引起了朱元璋的猜忌。在地方上，藍玉霸佔東昌民田，私蓄奴婢，縱奴作惡鄉里。此事後爲御史舉劾，但藍玉竟怒逐御史。他還讓家人私買雲南鹽1萬餘引(每引200斤或400斤)，進行走私。又因奏請多未採納，一直對朱元璋心懷不滿。這些做法，終於讓朱元璋動了殺心。
洪武二十六年(1393年)二月，錦衣衛指揮蔣瓛指控藍玉謀反，並在藍玉府庫內搜出近萬把倭制武士刀之說，朱元璋立刻以“謀反罪”處死藍玉，抄其家產，誅其三族，此案連累一萬五千人被殺，包括一公爵、十三侯爵、二伯爵，史稱“藍玉案”。未久潁國公傅友德、定遠侯王弼、宋國公馮勝等也在一兩年內相繼被殺，《國榷》洪武二十六年三月庚申條寫：“會寧侯張溫、都督蕭用等以黨誅。”至此，明初開國功臣幾被殺盡，僅存湯和、耿炳文等人，事實上所謂開國功臣應指洪武元年因戰功封公侯的人，包括藍玉及傅友德、馮勝都是開疆功臣而非洪武元年的開國功臣。朱元璋最後說：“自今胡黨藍黨概赦不問。”就事後來看，此案不過就是十餘年前胡惟庸案的延續，朱元璋的目的只是爲了徹底消滅開國功臣的一個藉口而己，所以纔會在事後，說自今胡、藍黨概赦不問。
