在人類戰爭史上，細菌武器的使用由來已久。最早使用細菌武器的實例，可追溯到1349年。韃靼人圍攻克裏米亞半島上的卡法城時，由於城堅難摧，攻城部隊又受到由中國向西蔓延的鼠疫大流行的襲擊，他們便把鼠疫死者的屍體從城外拋到城內，結果使保衛卡法城的許多士兵和居民染上鼠疫，不得不棄城西逃。
1763年，英國殖民主義者企圖侵佔加拿大，但遭到土著印地安人的頑強抵抗。一個英軍上尉根據他們駐北美總司令傑弗裏·阿默斯特的命令，僞裝友好，以天花病人用過的被子和手帕作爲禮物贈送給印地安人首領，以示安撫，結果在印地安人中引起天花大流行而喪失戰鬥力，使英國侵略者不戰而勝。
由於細菌武器如此“神威”，因而倍受侵略者的“偏愛”。他們不借代價，不擇手段地從事細菌武器的研究。據記載，在近半個世紀中，至少有三個國家使用了細菌武器。
在第一次世界大戰期間，德國曾派間諜攜帶馬鼻疽菌和炭疽菌培養物潛入協約國，將病菌祕密地投放到飼料中，或用毛刷接種到馬、牛和羊的鼻腔裏，使協約國從中東和拉丁美洲進口的3.45萬頭馱運武器裝備的騾子感染瘟疫，影響了整個部隊的戰鬥力。
日本
1935年，日本侵略者在我國哈爾濱附近的平房鎮建立了一支3000人的細菌部隊，這就是臭名昭著的731部隊，專門從事細菌武器的研製。每月能生產鼠疫菌300公斤、霍亂菌1000公斤、炭疽菌500～600公斤，並用中國人們作活體試驗，僅1940～1943年就使3000多人慘遭殺害。1940～1944年，日本帝國主義曾在我國浙江、湖南、河南、河北、山東和山西等省的11個縣市多次使用細菌武器，結果在寧波和常德等地鼠疫大流行。在太平洋戰爭中，日本公然使用了當今世界上最缺德的生物武器——“性病武器”，這是世界戰爭史上聞所未聞的醜行。
美國
美國研製生物武器，是從1941年開始的。1943年在馬里蘭狄特里克堡建立了陸軍生物研究所，從事生物武器的研製。根據美公開的記錄報告透露：1971～1977年間美國每年用於生物戰的經費都在1000萬美元以上，並有專門生產細菌武器的研究所、實驗場、工廠和倉庫。朝鮮戰爭期間，美國先後使用生物(細菌)武器達3000多次，攻擊目標主要是我國東北各鐵路沿線的重要城鎮如瀋陽、長春、哈爾濱、齊齊哈爾、錦州、山海關、丹東等，以及朝鮮北部的一些主要城鎮。
