毛文龍在戰爭所立赫赫戰功的確值得人稱讚，但是毛文龍此人其實是一個典型的刺頭。要是有一個能完全駕馭他的人在，那麼他就能發揮出極爲強大 的力量，但是一旦無人可駕馭他了，那麼他驕橫跋扈的性子絕對是展露無遺。
毛文龍後來在遼東的主帥是登撫袁可立，袁可立在毛文龍嶄露頭角之時就一直接濟毛文龍。無論是軍餉還是請功方面都給予毛文龍極大的優待，可見 他對毛文龍的期待。而毛文龍在他的領導之下，屢立戰功，當時朝廷還嘉獎道：“巡撫僉都御史袁可立厥治行勞哉，賜汝朱提文蟒。汝嘉而毛帥驕愎 不協，蠱於兵，滿蒲昌城襲報用敢獻功。”
後來袁可立請求辭官後，毛文龍欺瞞跋扈，與繼任的登萊巡撫們關係配合得極爲不好，這座烈馬再無人可以駕馭。
另外毛文龍性格中還存在着一個極大的缺點，那就是恩將仇報，眥睚必報。毛文龍之所以能屢建戰功，絕對離不開其上司袁可立的支持，後來袁可立 辭官，毛文龍再沒有立過像樣的戰功。就是這樣一個處處爲毛文龍着想的上司，在後來卻因爲清查軍餉一事，被毛文龍記恨，唆使諸多官員參奏袁可 立，致使其辭官。而袁可立得罪毛文龍的原因，完全是毛文龍本身的錯誤。毛文龍此人貪餉甚多，以致於袁可立每次爲其請增軍餉的時候，都得到文 官的反對質疑。
袁可立後來請查毛文龍本意是想讓文官看見毛文龍的每一份錢糧都用在了實處，哪知道毛文龍此人是真貪了軍餉。所以袁可立這麼一 請旨，立刻就得罪了毛文龍。
袁可立一走，毛文龍與好幾人繼任者都不和。後來袁崇煥作了毛文龍的頂頭上司，對於這麼一個刺頭，袁崇煥直接找了個原因就將其斬殺了。後世對 於袁崇煥該不該斬殺毛文龍存在異議，有人說袁崇煥斬殺毛文龍是對的，畢竟新官上任三把火。也有人說，毛文龍立了那麼多戰功，而在斬殺他之後 ，袁可立辛苦經營多年的海上防線蕩然不存，致滿人敢傾國中之力大舉犯明，所以斬殺毛文龍是不對的。
