巧克力最早不是一塊含在嘴裏吃的，而是一杯飲料，1300多年前，約克坦瑪雅印第安人將烘焙過的可可豆磨成粉，往裏面加入麪粉和水等東西，把所有粉末都攪拌成糊狀，並且冒出泡，巧克力飲料就做好了。
巧克力飲料只有高層貴族人士才能喝，這個習慣一直到16世紀都還是這樣，1526年，西班牙的軍事家荷南多·科爾特斯在墨西哥看見當地國王在飲用巧克力飲料，他聞到這種飲料散發出醇醇的香氣，但嚐了一口覺得很苦，他把這種飲料帶回去後自己也做了一杯，但在原來的製作方法做了一些小改動，他加了糖，使飲料喝起來甜一些。1876年，瑞士人彼得又在荷南多基礎上加了牛奶，現代版巧克力就有了雛形。
巧克力是有藥用價值的，最早是美洲原住民用來治療心絞痛和肝臟等疾病，1642年法國人將巧克力引進國內，但是將它作爲藥引進來的，巧克力還一度被法國人看出是“珍貴的藥品”。
人們是從19世紀中期才把巧克力看成是食物。巧克力傳入中國的時候是康熙年間，那時的康熙也將巧克力看作是藥，就把中國第一塊巧克力引進來，他是第一個嘗試了巧克力的中國人。
康熙時期的中國經濟發達，物產富饒，他很排斥外國的東西，但是1693年夏天，39歲的康熙突然得了瘧疾，儘管是在大夏天他還是被冷得“打擺子”，渾身抽搐個不行，宮裏的太醫卻無藥可治。
康熙爲了保命，重金向民間徵集藥方，最後靠法國傳教士帶來的西藥“金雞納霜”給治好了，康熙因爲這件事就不再盲目排斥西藥，還對西藥產生了興趣。1707年，他從外國傳教士那聽來了巧克力，就傳旨下去讓掌管西藥的西方人赫世亨去找。
清朝時期的巧克力還不叫“巧克力”，而是叫“綽科拉”，從巧克力的英文音譯過來的。當時，赫世亨的好朋友，意大利傳教士鐸羅來到中國，赫世亨就找鐸羅要巧克力，鐸羅一下就拿出150塊，赫世亨從裏面精挑細選了50塊最好的給康熙，並且還給康熙準備了一套吃巧克力的杯勺。
康熙也是第一次吃巧克力，又沒有人告訴他巧克力藥效，萬一把他吃死了怎麼辦?康熙爲了保險起見就讓赫世亨把巧克力藥性寫出來，三天之後交。赫世亨以前也沒吃過巧克力， 只好拿着巧克力到處去問用處，三天之後洋洋灑灑寫上了900多字的說明書，把說明心滿意足交給康熙。
赫世亨在說明裏是巧克力其實更像是一種茶，“老者、胃虛者、瀉肚者均可飲用，助胃消食，大有裨益。”赫世亨說的這段話有科學依據可以支撐，科學家經過研究發現黑巧克力的纖維素能夠幫助腸道蠕動，能促進消化還有一點止瀉的作用。
康熙看了赫世亨這900多字的說明只回了三個字，這三個字就是“知道了!”康熙拿起巧克力喝了一口，喝第一口差點沒把巧克力全都給吐出來，因爲巧克力實在是太苦了，康熙第一次喝沒經驗，喝了一大口哭得他急忙要用水漱口。
茶雖然也有點苦，但茶的苦裏面還帶着一點清香，事後會覺得有點甜，可巧克力實在是苦得難以下嚥。康熙從這以後再也不碰巧克力，直到清末，西方東西大量進入中國，國人才逐漸喜歡上巧克力。
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