公元前149年，羅馬人爲免迦太基回覆元氣，決定先發制人，圍攻迦太基。迦太基人在頑強抵禦三年後，於公元前146年春被羅馬軍統帥 - 埃米利安·科爾內利烏斯·西庇阿所攻滅。此役後，羅馬決定把迦太基城夷爲平地，並且血洗迦太基，挨房搜索，將所有居民找出殺死。而迦太基港口亦被毀滅，從此迦太基作爲國家的階段成爲歷史。第三次布匿戰爭只持續了三年(公元前149年 - 公元前146年)，比前兩次都要短，可見羅馬先發制人的決定並不錯誤。
而據說迦太基周圍的田野被撒了鹽，要它不能有任何生命生存。不過撒鹽這回事在戰史裏沒有記錄，而且當時鹽很貴重，所以當代的學者認爲撒鹽只是一種象徵，並沒有真正做。
在迦太基城破之後埃米利安·科爾內利烏斯·西庇阿失聲痛哭，但他不是爲勝利也不是爲陣亡的將士哭泣，而是爲羅馬的敵人——迦太基人的悲慘遭遇而哭泣。當旁人問及原因時，他回答道：“這曾經是一個偉大的民族，擁有着遼闊的領地、統治着海洋，在最危急的時刻比那些龐大的帝國表現了更剛毅、勇敢的精神，但仍避免不了滅亡。想想過去的亞述帝國、波斯帝國、馬其頓帝國還有那個高傲的特洛伊，又有哪個能避免這樣的結局。我真害怕在將來有人會對我的祖國做出同樣的事。”果不其然，迦太基城破556年後，羅馬遭受了同樣的命運。
更加具有諷刺意味的是，在455年已經佔據北非並以迦太基爲首府的汪達爾王國，在其國王蓋塞裏克的領導下趁西羅馬帝國內亂從迦太基發兵佔領羅馬，並有計劃地對該城進行長達兩個星期劫掠和屠殺。羅馬許多建築被破壞，無數珍寶被劫掠一空。
羅馬人摧毀迦太基之後，在前122年便建立新城於原迦太基城廢墟領土之上，在這裏建立了殖民地，後來人口曾達六十萬，成爲當時僅次於羅馬的第二大城。之後在凱撒時代，羅馬亦曾把一些沒有土地的公民遣送至這裏，而由奧古斯都於公元前29年統治開始，羅馬將迦太基設爲非洲阿非利加省的一部份。
羅馬皇帝哈德良(Hadrian)還修築了巨大的馬加蓄水池和著名的安東尼浴場，工程從哈德良皇帝執政時期開始，到西元二世紀羅馬皇帝安敦寧·畢尤(Antoninus Pius)當政時竣工。在公元4世紀，羅馬帝國分裂，迦太基隸屬西羅馬帝國。而在4世紀時，西羅馬帝國逐漸崩潰，西元439年汪達爾人乘機入侵迦太基，並佔領了非洲北部沿海大片土地，成立了汪達爾-阿蘭王國。
西元533年成爲東羅馬帝國的屬地。在這裏產生了第一所基督教拉丁文學院。許多著名的基督教衛道學者如特土良與聖奧古斯汀都曾在此成長、寫作。到了公元7世紀，阿拉伯人向亞、非、歐三大洲的鄰國入侵，在其倭馬亞時代征服了迦太基在內的北非大部分領土。西元698年，阿拉伯人侵入該城，迦太基又被嚴重破壞，後成爲阿拔斯王朝的地方政府所在地。1217年-1221年，當第五次十字軍東征橫掃過迦太基之後，這座歷經滄桑的古城幾乎被嚴重得損壞殆盡直到終於在歷史中完全消失。
