索額圖在康熙朝被康熙定爲“我朝第一罪人”，但實際上這個“我朝第一罪人”在康熙朝的功績卻一點也不小。索額圖平生最大的功績有四個，一是幫助康熙生擒鰲拜;二是爲平定三番出力;三是簽訂《尼布楚條約》;四是從政準格爾。
順治十八年，順治帝福臨去世，選定三皇子玄燁爲皇位繼承人。玄燁繼位之後，改元康熙。康熙當時年僅八歲，離他能真正親政還有很長的一段時間。順治帝爲了維護國家的穩定，遂選出四位輔政大臣，即：索尼、遏必隆、蘇克薩哈、鰲拜。主君年幼，難免大權旁落，在各種原因下，鰲拜獨攬大權，成爲在朝堂上說一不二的大權臣。鰲拜驕橫跋扈，手中又大權在握，便難免開始輕視皇權，許多時候都不將康熙放在眼裏。爲了除去鰲拜，康熙和孝莊進行了一番策劃。
在康熙和孝莊的計謀中，索尼一家是最關鍵的一點。索尼是四位輔政大臣之首，在鰲拜專權的情況下，只有他能與鰲拜爭奪一二。因此孝莊太后親自指定索尼的孫女，索額圖的侄女爲康熙皇后，即後來的孝誠仁皇后。此後索尼一家，因爲孝誠仁皇后的原因與皇家綁在一起，自然全力牽制鰲拜。
康熙六年六月，首輔索尼病故，14歲的康熙帝正式親政，在太和殿受賀，大赦天下。但親政僅十天後，鰲拜即擅殺同爲輔政大臣的蘇克薩哈，數天後與遏必隆一起進位一等公，實際政局並不受康熙帝直接掌控。熙八年五月，康熙帝“以弈棋故，召索相國額圖入謀畫”，採取突襲的方式，逮捕鰲拜，懲其黨羽，康熙帝始得真正主持朝政。
康熙十二年三月，以平南王尚可喜請求歸老遼東，但請求留其子之信繼續鎮守廣東爲引線，引發了是否撤藩的激烈爭論。最後康熙帝認爲“藩鎮久握重兵，勢成尾大，非國家利”，決定下令“撤藩”。在此次撤蕃之中，索額圖認爲撤蕃會動搖國家安定，因此主張斬殺建議撤藩的臣子，此事遭到康熙帝斥責。
雖然遭到斥責，索額圖仍然儘自己的臣子之職，不僅爲康熙皇帝巨匠人才，並且還積極的出謀劃策。雲貴總督周有德請求在進兵時應該專任一人，索額圖上奏：“若一路進兵，從之猶可?分道並進，如何可行?”他主張：“今大兵已經遣發，若又令其前進，多用官兵，必致勞困矣!”《嘯亭雜錄》記：“索(額圖)相當權時，多謀略，三逆叛時，公料理軍書，調度將帥，皆中肯要。”
明末清初，沙俄趁中國戰亂，多次侵襲邊界，並且佔領了一部分土地。三藩之亂後，康熙組織軍隊，集中反擊沙俄，打響兩次雅克薩反擊戰，大獲全勝。戰敗的沙俄派出使臣，請求議和，停止戰爭。索額圖擔任清與沙皇俄國談判東北邊界問題的首席代表，簽定了第一個中俄條約《尼布楚條約》。在此次條約的簽訂中，索額圖據理力爭，並且言辭堅決，反駁了沙俄反誣中國發動戰爭之語，在康熙劃定的底線上與沙俄簽訂平等條約，爲祖國的統一做出重要貢獻。
《尼布楚條約》簽訂後，康熙集中對付準噶爾叛亂，並且御駕親征。索額圖隨行在列，多次爲戰鬥的勝利做出貢獻。諸如截斷噶爾丹後路，在中路給予敵人痛擊，隨康熙帝到寧夏，指揮戰事。清軍追殲噶爾丹，噶爾丹衆叛親離，走投無路等等。
儘管索額圖一生建立了這麼多功勳，最後還是因爲捲入皇子之爭中，被康熙判爲“我朝第一罪人”。康熙將太子發動叛亂的原因，歸結於索額圖等人的誘導之下，因此纔對這個以往的功臣如此對待。自古以來，皇位之爭就是這麼殘酷，站錯了隊就要付出代價。想來早在索額圖全力支持太子之後，就已經有了這個覺悟吧!
