明鄭又稱「鄭氏時代」，爲起始於中國明朝遺臣鄭芝龍以太師之位，獨攬南明朝政開始的家族政治勢力;1653年，鄭成功受封延平郡王，建廈門爲思明州，宗永曆爲正朔，並自設知州及六官。而由中國南明大臣鄭芝龍初創、鄭成功發揚光大的明鄭政權勢力，除了支撐南明帝業外，最重要的貢獻，爲在臺灣建立延平王國，並在臺灣立下了重要文化經濟基礎。
初期，明鄭不但控制海域，造成「海舶不得鄭氏令旗者，不能來往」現象，南明中期(1653年)則自鑄永曆通寶稱王於廈門，後期(1661年)更於臺灣建立該島的第一個漢人政權。鄭氏勢力自鄭芝龍經鄭成功到鄭經以迄鄭克塽，刻劃了一個閩南海商集團及政治勢力的興起與崩潰。
1663年，明鄭政權實際領導人鄭經纔將政經中心從廈門移往臺灣，並建立延平王國，惟明鄭統治轄域仍包含福建的金、廈兩島。1664年4月，明鄭於多次戰役後，喪失金廈，明鄭勢力正式於中國大陸消失，轉以臺灣爲最後根據地。惟因清朝軍事攻擊等因素，明鄭政權於1683年隨延平王國降清而滅亡。
