萬曆怠政指的是在清朝人編纂的《明史》中萬曆帝在位期間長期不理朝政的事情。
萬曆十年，內閣首輔張居正去世，20歲的萬曆帝正式親政。在最初的幾年，年輕的萬曆帝還兢兢業業、恪職盡守。如萬曆十二年八月至十三年五月京師大旱，萬曆帝決定親自祭天祈雨。祈雨當天，萬曆帝親率百官步行十餘里來到天壇，經過一番冗長而繁複的祈雨儀式後，萬曆帝又不顧勞頓，堅決拒絕乘輦，再次頂着烈日步行回宮。尤其是，爲了表示祈雨的虔誠，萬曆帝特意要求免除清道，破例讓沿途百姓爭相一睹天顏。此情此景，令羣臣百姓無限感動，不少人甚至潸然淚下。
但是，從萬曆十四年以後，萬曆帝就開始了嚴重怠政行爲，並創下了30年不上朝的紀錄。萬曆帝的怠政，使明王朝中央政府幾乎陷於癱瘓，從此迴天無力，以致《明史·神宗本紀》中指出，“明之亡，實亡於神宗”。
而也有人對於萬曆怠政的說法存在質疑，認爲是清朝人在編纂《明史》中對萬曆帝的污衊。
後人在分析萬曆怠政的原因時，尋找了許多理由。對萬曆怠政前的巨大反差。原因或許只在於，萬曆的怠政，其實就是一種超乎常理、缺乏恆心的懶惰行爲的極致表現罷了。
然而萬曆朝也經歷許多大事，比如萬曆三大徵、國本之爭、梃擊案風波等。
