朱元璋就立儲問題，曾經悄悄徵詢過大臣的意見。他問翰林學士劉三吾：“太子死了，皇長孫(朱允炆)年幼不懂事。治理國家必須選對人，我想讓燕王接班怎麼樣?”
劉三吾是知識分子，你問他誰當儲君，他當然只推薦自己的同類。他頭搖得像撥浪鼓：“立燕王絕對不行!如果立燕王，那麼秦王、晉王怎麼辦?皇長孫朱允炆四海歸心，大家都擁護他，您可以安心睡大覺。”
文官們擁護朱允炆，因爲他是文人，是大孝子又是大好人，上臺後能實行文明德化之治，而不是軍事化的高壓獨裁。朱元璋的統治太過猛烈，官員暗地叫苦，百姓生活在水深火熱之中，長久下去沒人吃得消，國家客觀上需要一位陰柔、仁愛的皇帝，讓人民歇歇腳、喘口氣。
朱允炆非常有孝道。而在爭奪皇位的鬥爭中，“孝”就是奪取皇位繼承權的祕密武器。所以，朱允炆一定要將“孝”進行到底。
朱元璋欣賞四子朱棣的“武”
對於第四子朱棣，朱元璋確實非常欣賞，尤其欣賞他的“武”，這是朱允炆不具備的特殊優勢。
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朱棣是聞着戰爭的硝煙味長大的，1360年4月17日出生於南京，正是陳友諒大舉進攻南京的那一年。他11歲封燕王，17歲迎娶徐達的長女，20歲就藩北平。朱棣的才能不在朱元璋之下，彎弓射大雕不在話下，尤其喜歡打仗，智謀過人，知道怎麼打勝仗。作爲罕見的勇士和智慧人物，朱棣可謂一代“戰神”。現在他33歲，正當青春年少。
論才能和胸襟，朱棣都勝過朱允炆。一次，大家在宮裏看賽馬。朱元璋出上聯：“風吹馬尾千條線。”朱允炆沒有打仗經驗，所見不過平凡瑣事，憋足勁想出“雨打羊毛一片氈”，軟綿綿的，沒什麼味道。而朱棣見過世面，巧對“日照龍鱗萬點金”，氣魄宏大，朱元璋聽了非常高興。
燕王朱棣就藩北平，以他爲衆藩王之首，與寧王、晉王、肅王、秦王等沿長城一線封國，爲天子守邊，抵禦北方蒙古人的侵犯，號稱塞王。朱元璋允許他們擁有3000人的護衛，最多的可以達到1.9萬人。燕王、晉王、秦王勢力最強，多次奉詔攻打蒙古，即使傅友德、藍玉這樣的大將也要聽塞王指揮。尤其是燕王朱棣，負有控制北部門戶的重任，能夠直接指揮的軍隊多達30萬人，軍中大小事自己裁決，只有天大的事才向朱元璋彙報。
1390年，一場戰鬥使年僅30歲的朱棣威名遠揚。那年元旦剛過，朱元璋命令燕王和晉王分兵合擊，打垮元代丞相咬住、平章乃兒不花。
朱棣首先派出幾股哨兵四出偵查，摸清乃兒不花的確切位置。3月，天下大雪，千里荒原上銀裝素裹，車馬輜重行進十分困難，士兵們凍得直打哆嗦。將領們請求燕王安營紮寨，等大風雪過後再想辦法。
朱棣說：“戰機就擺在你們眼前，你們怎麼看不見呢?這正是出奇制勝的大好時機!”命令大軍頂風冒雪，快速而進。大軍出現在乃兒不花面前時，他竟然還在帳篷裏烤火。
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朱棣圍而不殲，派乃兒不花的好朋友、降將觀童勸降。乃兒不花知道是雞蛋碰石頭，只好請降。朱棣擺酒設宴，酒喝得十分爽，令乃兒不花感動得眼淚嘩嘩的，主動要求勸降咬住。
朱棣第一次大規模出征，兵不血刃就大獲全勝，讓朱元璋非常高興，賞賜寶鈔100萬錠，誇讚朱棣：掃清沙漠裏的蒙古人，就全靠你了!
而另一路晉王，生性怯懦，一踏上當年成吉思汗征戰的土地，就兩腿發虛，走一走停一停，不敢深入蒙古腹地，連個兔子都打不到。
朱棣的血統帶來麻煩
朱棣和朱元璋是同類，雄才大略，各方面能力都比朱允炆傑出，更適合當皇帝。但是，血統卻給他帶來了大麻煩。他真的是龍子嗎?
江山當然只能交給親生骨肉坐，必須是純種的龍種，就是說是馬皇后所生。嫡長子繼承製在中國延續幾千年，朱元璋跳不出這個框框。
朱棣可能不是馬皇后生的，所以朱元璋不會選朱棣接班。
朱棣可能是一個妃子生的，或許這個妃子還是少數民族。有可能是高麗人，究竟是北方高麗民族，還是來自朝鮮半島，很多人都弄不清楚。也有人稱朱棣的媽媽是元順帝的妃子，甚至可能是蒙古人。
根據管理宗廟祭祀、禮樂的官方機構太常寺的記載(現已丟失)，淑妃李某生了朱標、秦王和晉王，跟馬皇后沒什麼事兒。而另外一個妃子生了朱棣，這個妃子就是石頁妃。
朱棣稱帝后纂改《太祖實錄》，把能得到的資料全部纂改，拼命證明自己就是馬皇后生的，還拿出很多證據證明他當皇帝是合法的，證明朱元璋有意傳皇位給他。
而朝鮮的一條史料足以戳穿朱棣的謊言。1389年，朝鮮使臣權近等人在北平拜謁燕王，回國後寫了一本《奉使錄》。裏面說，他到北京燕府去見燕王，可是很不湊巧，那天是農曆七月十五日，是燕王媽媽的忌日，燕王不見客人。馬皇后是八月初十去世的，所以說朱棣不是馬皇后親生。
朱元璋艱難決定：立16歲的朱允炆爲皇太孫
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只有嫡長子繼承皇位，大家才擁護。朱棣不是馬皇后的親兒子，所以經過權衡，朱元璋作了一個異常艱難的決定：立16歲的朱允炆爲皇太孫。這讓朱棣十分窩火，十分不服氣。一次，他用手拍拍皇長孫朱允炆的背，譏諷地說：“沒想到我侄兒還能有今天的榮耀啊!”這一情景，恰好被朱元璋看見，厲聲責問朱棣：怎敢對皇長孫如此無禮?朱允炆急忙打圓場，纔沒讓朱棣十分難堪。
立皇太孫的第二年，朱元璋還是擔心朱允炆太文弱，壓不住陣腳，管不住軍隊，於是開始大殺功臣，藍玉、胡惟庸集團先後被清洗。
用歷史的眼光來看，朱元璋當初的選擇是個錯誤。如果選朱棣當皇帝，就不會出現後來歷時4年的內戰。但歷史不相信道德，也不相信眼淚，它只相信實力。朱棣發動戰爭，將朱允炆趕下臺取而代之。爲抹殺篡權的形象，防止天下人心不穩，朱棣拼命說謊，證明自己就是馬皇后的親兒子。指“馬”爲母，萬不得已……
