穆爾所率英軍自科魯尼亞撤走之後，拿破崙便以爲他已排除了英軍再次干涉西班牙的一切可能性。誠然，葡萄牙仍有待征服，但此事可以放在徹底打敗奧地利以後再說。他現在的當務之急是竭盡全力攻佔奧地利首都。通往維也納的捷徑是經由多瑙河谷。1805年，烏爾姆大捷之後，他就是由此打到維也納的。
穆爾所率英軍自科魯尼亞撤走之後，拿破崙便以爲他已排除了英軍再次干涉西班牙的一切可能性。誠然，葡萄牙仍有待征服，但此事可以放在徹底打敗奧地利以後再說。他現在的當務之急是竭盡全力攻佔奧地利首都。通往維也納的捷徑是經由多瑙河谷。1805年，烏爾姆大捷之後，他就是由此打到維也納的。
1月24日，拿破崙從巴利阿多利德一回到巴黎，便立即開始爲新的多瑙河戰役組編部隊。他認爲奧軍在4月15日之前不會行動，所以覺得有充裕的時間作準備。2月15日，他命令當時正在巴利阿多利德鎮守西班牙北方各省的貝西埃爾把近衛軍送回巴黎。其後一週，情報部門向他呈交了一份奧軍最近兵力部署報告。當時奧軍編爲九個軍，由查理大公指揮:
右翼位於波希米亞計有:貝利加德伯爵，柯羅華特伯爵，羅森貝格親王，十二萬人;列支敦士登的約翰親王，四萬五千人。
左翼位於施蒂里亞和卡林西亞計有:馮·席勒男爵，卡斯特勒將軍，蓋雷將軍，九萬五千人;
合計:二十六萬人。
另有兩個軍作預備隊，計十萬人，一支在加利西亞由費迪南大公指揮，另一支由路易大公指揮保衛維也納。
查理大公的打擊力量顯然大大超過了法軍在德意志境內可調集的兵力，因爲把達武、烏迪諾和貝爾納多特的兵力加起來也不過九萬人。所以根本不存在拿破崙象1805年那樣立即採取主動進攻的問題。對此，拿破崙明智地決定採用攻勢防禦戰略，聚集兵力，後發制人，待敵暴露意圖後予敵以打擊。所以，在戰爭初期，他只命令德意志境內的部隊在多瑙河谷的雷根斯堡附近集結，靜觀奧軍行動。當務之急是增強德意志兵團的兵力，但由於西班牙的局勢仍不太穩定，他也難以從該戰區抽調過多的部隊。
