清原氏是日本平安時代東北地方一個有力氏族，他們是蝦夷人但自稱是天武天皇皇子舍人親王后裔。他們曾在前九年之役協助源賴義平定安倍氏，但後因家族內鬨在後三年之役被源義家所滅，領地被奧州藤原氏控制。
日本平安朝大姓 清原，清原氏是皇族下賜之姓，所以從血統來說，他們與源氏、平氏、橘氏、在原氏相同。不過與其他三個家族相比，他們遠離皇族的血統比較遠，源氏大多是初代皇子，平氏和橘氏還有在原氏都是二代王子的，而清原氏則大約有四代纔出離皇室。
清原氏繼承的是天武天皇的血脈。天武天皇子嗣衆多，其中六皇子就是清原氏的老祖宗，即舍人親王。舍人親王長壽，所以成爲皇室重臣，在藤原不比等死後，他成爲右大臣與擔任左大臣的長屋王一起成立皇族的朝廷，在這段時間裏，太政官是由皇族把持的。不過隨着天平元年(729)的長屋王之變，舍人親王雖然沒有受到波及，但是勢力已經敗給了得到光明皇后支持的藤原氏。舍人親王生有八子，其中七子大炊王最後即位成爲了淳仁天皇，而他的哥哥，也就是舍人親王的長子三原王，就是後來清原氏的直系先人。清原氏是由兩支構成的，即爲三原王之子小倉王和石浦王兩支。延歷23年(804)，小倉王和石浦王上奏朝廷，希望下降臣籍，更好的拱衛皇室，於是桓武天皇下詔，賜姓小倉王和石浦王的後人“清原真人”，於是清原氏就誕生了。不過與其他皇族賜姓之後不同的是，清原氏一開始受賜“清原真人”姓氏的兩人，即貞代王和繁野王，繁野升上了高位，但是繁野王流並沒有繁榮，反之，貞代王流雖然後世出了幾乎清原氏所有的名人，但是貞代王本人只是大監物的官位，並且子孫的官位一直在殿下人和殿上人交接的從五位徘徊。
舍人親王：(676~735)天武天皇皇子。是《日本書紀》的編纂總裁。在藤原不比等死後，以一品親王的身份出任右大臣，和侄子左大臣長屋王共同執政。後來失勢。由於兒子大炊王后來成爲淳仁天皇，所以加封舍人親王諡號爲：崇道盡敬皇帝。三原王：(?~752)舍人親王之子，也被稱作御原王。以王的身份出任彈正尹，後來藤原廣嗣之亂時，出任治部卿，之後歷任大藏卿、中務卿，最後達到正三位。清原 夏野：(782~837)三原王之孫，小倉王第五王子。賜姓“清原真人”，官位從二位右大臣。平安時代著名皇族學者，政治家，經濟家，甚至還有說法他參與了《令義解》。
清原氏初期，並沒有出名的人物，以貞代王流來說，大概是這樣的情況：貞代王 官位正五位下大監物----清原有雄 官位越前守----清原道雄 官位大學頭----清原海雄 官位未知 ----清原房則 官位豐前介可見清原氏在平安初期一直是國司階級。不過自清原氏從皇族分離出來之後，一直注意文學等修養，所以一向是文學、禮法之大家，但是其官位並不高。可以說是學問大家，但是對政治是無力的。而在平安中期，清原氏出了清少納言，流傳下來了《枕草子》這樣的舉世名作，由於這樣的雅名，導致清原氏在後世的青雲。
清原 深養父：(?~?)房則之子，歷任內匠允、內藏大允從五位下。平安中期著名歌人、古琴名人。中古三十六歌仙之一。《古今和歌集》存有17首。清原 元輔：(908~990)深養父之孫。歷任河內守、肥後守，從五位上。天曆五年(951)參加《後撰和歌集》的編纂，被認爲是三十六歌仙之一。清 少納言：(966~1025)元輔之女。據稱原名清原諾子。精通漢學、和歌，天元四年(974)嫁給橘則光，後來離婚，再嫁給藤原棟世。後來成爲一條天皇中宮藤原定子的女官，在朝中頗有人緣，留下了名作《枕草子》，與紫式部的《源氏物語》並稱“日本文學雙壁”。
嚴格的說，清原氏的譜系到這裏就完結了，因爲在這裏譜系發生了混亂。一方面，京都的清原氏成爲了沒落的貴族，下行到下野、紀伊、豐後諸國，並且分出了出羽清原氏。但是總體來說，京城的清原氏漸漸絕跡。另一方面，日本還有一支氏族獲賜了“清原”的氏名，不過他們的姓是“朝臣”，這就是神別家由來的海氏清原氏。所謂神別，就是日本氏族的四大由來。“皇別”、“神別”、“豪族”、“渡來”。皇別就是皇族下賜之姓氏，神別則是在日本神話中，非天皇之祖天照大神一系的其他神明的子孫，豪族就是地方的土豪，渡來則是從朝鮮、中國來的氏族。簡單說，在原先的清原氏沒落之後，神別的清原氏，便繼承了原先清原氏的地位，並且大肆的修改了原先清原氏的譜系，將自己融入了以前的清原氏當中，所以清原氏的血脈很亂，譜系也經過很大的修改，所以很難去研究。
