從時間上推算，米諾斯文明應該早於邁錫尼文明，在公元前3000年已開始使用青銅器，文明達到相當的高度。但是在之後的一段時間，米諾斯文明突然消失，取而代之的是之後的邁錫尼文明。考古發掘顯示，米諾斯文明很有可能是因爲一場巨大的火山噴發而終結的。許多米諾斯藝術品，已顯示出其對自然的敬畏，包括火山，大海。古生物樣本顯示，在米諾斯文明的最後階段，出現過一場類似核冬天的災害。米諾斯的文明很有可能毀於地震，剩餘人口因爲饑荒而消亡殆盡。邁錫尼人或許就是出現在米諾斯文明最低谷，並隨即用武力征服了米諾斯。從邁錫尼人登陸後，建造的許多城牆，以及加固的工事，還有保留至今帶有戰鬥裝飾的劍鞘，都可以看出邁錫尼人是一個比米諾斯人還要好鬥的外向型民族。推測這樣的戰鬥應該不止步於克里特島，邁錫尼人的戰鬥範圍有可能蔓延整個愛琴海。米諾斯人奠定了希臘文明的基調，創造性的使用了線性a，邁錫尼人消滅了米諾斯人，佔據了克里特島。開始使用線性b。並開始向外發散，將克里特文明傳遍愛琴海，愛琴海文明吸取了克里特文明及文字，並進一步創造了更富影響力的希臘文明，但保留了許多比如尚武，好鬥，自然崇拜，多神(女神崇拜)等文化特點。
不過這並不是說兩者之間全無關聯。米諾斯和邁錫尼人的遺傳背景頗爲相似，有超過四分之三的祖先同爲小亞細亞和愛琴海的新石器時代早期農民。然而，邁錫尼人另有來自於東歐和西伯利亞狩獵採集者的血緣關係，而米諾斯人並沒有。這一證據比較支持邁錫尼人和米諾斯人有遺傳上的連續性。文章對邁錫尼人與亞歐大陸人的基因融合過程進行了進一步討論。
所以說米諾斯其實是邁錫尼，也同時是希臘人的部分祖先。它們二者的文明傳承雖然有一部分聯繫，但是基本屬於相互差異極大的兩個獨立文明體系。
