早年經歷
蒲壽庚是宋元時期的知名人物。他精通阿拉伯語、占城語(越南)，這對外貿而言就有很大的便利。南宋時期，他既擔任過泉州市舶司提舉，同時也因爲外貿累積大量財富，成爲泉州首屈一指的富豪。
13世紀初宋寧宗嘉定十年(1217年)，蒲家族從廣州舉家遷往泉州定居。而蒲壽庚的父親蒲開宗，還曾擔任過安溪縣主簿，並曾因貿易有功，被南宋朝廷授予“承節郎”的官銜。
抵禦海寇
南宋時，南海海寇猖獗。泉州共發生海寇犯泉事件六起(不含山寇劇盜)，而《福建通志》記八起，兩書最後一起海寇犯泉都在鹹淳十年(1274年)。
而此時的蒲壽庚只不過是個小商人，略帶有亡命徒性質的商隊。鹹淳十年(1274年)，海寇襲泉州，官兵無能爲力。蒲壽庚與其兄蒲壽宬 爲保護家族的巨大利益，憑藉強大的海上力量，助官憲擊退之，因功授福建安撫使兼沿海都置制使(合稱福建安撫沿海都置制使)，安撫一路之兵事民政，執掌福建兵事民政要職。統領海防，權力很大。
泉州學者吳幼雄據《宋史·瀛國公度宗本紀》考證，鹹淳十年(1274年)二月時，福建安撫使是趙順孫，可知蒲壽庚之任福建安撫使應在鹹淳十年(1274年)二月以後。
迅速發家
蒲壽庚亦官亦商，官商合一，可以憑藉權力更大規模地開展香料貿易，並可通過各種“合法”手段攫取利益，增加財富。
蒲壽庚於宋末壟斷泉州香料海外貿易近30年，“以善賈往來海上，致產鉅萬，家僮數千。”蒲壽庚擁有大量海舶，1973年，在後渚港發掘出一艘南宋遠洋貨船，載重量200多噸;船上香料遺存豐富，有降真香、檀香、沈香、乳香、龍誕香、胡椒等。一些學者認爲，這艘海船可能是蒲氏家族的香料船，“與蒲家香業有密切的聯繫”。
德祐元年(1275年)三月，即蒲壽庚受任爲福建安撫沿海都置制使後不久，蒲壽庚參與了一場反抗宋廷的戰爭。時右丞相陳宜中爲遷都事，殺殿前指揮使韓震，引起殿前司左翼軍兵叛。左翼軍統領夏璟聯合蒲壽庚，連續挫敗宋軍，取得瑞安(溫州)、溫陵(泉州)、三陽(潮州)大捷 。
顯赫的權力與雄厚的海上實力相結合，使蒲氏成爲宋元鼎革之際一位舉足輕重的人物。因此，景炎元年(1276)任命蒲壽庚爲福建、廣招撫使，總海舶。兼“主市舶”，賦予更大的權力。
屠盡宋室
宋高宗建炎三年，300多趙宋宗室子弟隨南外宗正司遷至泉州，並在這裏繁衍生息。到了宋末，宗室成員已達到3000多人。不過在據史書及文人記載，宋元鼎革之際，在泉州的南外宗子們，卻被蒲壽庚殺害殆盡。
這事還得從南逃的南宋幼主說起。德祐二年(1276年)二月，元軍南下，包圍臨安。元軍善於陸戰而短於海戰，聞蒲壽庚老於海事，擁海舶至多，若能招得蒲壽庚，既能嚴重削弱殘宋的海上力量，又能借蒲氏之力給殘宋毀滅性打擊。在元軍攻臨安之前，元軍統帥伯顏派遣不伯、周青招撫蒲壽庚、蒲壽宬兄弟未果。同年三月，元丞相伯顏陷臨安，恭帝降，南宋事實上滅亡。南宋遺臣奉恭帝兄趙昰入閩，欲圖恢復。同年五月，趙昰在福州另立朝廷，是爲端宗，年號景炎元年。
同年十一月，元兵由浙江入福建。爲避元軍，南宋陳宜中、少保張世傑率舟師十萬，奉宋端宗趙昰及衛王趙◇、楊太妃等，由福州航海至泉州城南郊法石下輦村，“欲作都泉州”。宋室冀得蒲壽庚之助，以繼續在閩、廣沿海地區堅持抗元，當時的南宋孤臣陸秀夫、張世傑等人，帶着兩個娃娃皇帝端宗、幼主抵達泉州，趙呈率殘部退至泉州城外法石寨，在這裏的趙宋宗室子弟打算接應他們，但蒲壽庚拒不支援宋軍，卻“閉門不納”、“閉門拒命”，禁止宋軍進入泉州，致使這一干人無奈繼續南逃，撤往廣東。因此，宋軍改泊泉州外渚獺窟。張世傑只得護送端宗匆遽移粵，經漳州趨潮陽。
宋軍以船舶軍資兩皆不足，張世傑臨走時強徵蒲壽庚的商船，“掠其舟並沒其貲”，採用暴力直接抄沒他的家產以充軍資。搶走停泊在法石一帶的蒲氏海舶400多艘。“掠蒲氏海船二千艘，沒其貨物”，忍無可忍的蒲壽庚把怒氣撒在定居泉州的南宋宗子身上，“乃怒殺諸宗室及士大夫與淮兵之在泉者”。蒲壽庚並殺宋宗室及士大夫與淮兵之在泉者約3000人。
叛宋仕元
蒲壽庚派親信孫勝夫祕密出城，迎接南下途中的元軍。於德祐二年(1276年)十二月初八(公曆1277年元月)，元兵由浙江抵泉州，蒲壽庚與州司馬田真子獻城降元。
蒲壽庚的降元，背後有一股強大的地方精英集團在支持他。他們對當地的政治和防務，都有很大的左右力量，如世居泉州、三代武衛左翼軍統領夏璟，有調遣泉州軍隊之權的田真子，以援城功授永春縣達魯花赤的林純子，“以全城功歸諸故家”的顏伯錄，蒲壽庚的黨羽孫勝夫、尤永賢、王與、金泳等。
蒲壽庚降元，以所擁有的海舶交元軍進攻殘餘宋師。元軍將領董文炳率部抵泉時，擅解所佩金虎符贈蒲壽庚，此舉事後得到元世祖的嘉許。元廷授蒲壽庚爲昭勇大將軍、閩廣都督兵馬招討使兼提舉福建廣東市舶。
降元后，受到元世祖忽必烈的重用。
至元十四年(1277)“進昭勇大將軍，閩廣都提舉福建廣東市舶事，改鎮國上將軍，參知政事。並行江西省事。”至元十五年(1278)三月又升“蒲壽庚行中書省事於福州，鎮撫瀕海諸郡”。
助元滅宋
至元十四年(1277年)，元朝於泉州設市舶司。四月，董文炳謁見元世祖時說：“壽庚素主市舶，謂宜重其事權，使爲我捍海寇(指南宋殘餘勢力)，誘諸蠻臣服。”這正是元朝統治者重用蒲壽庚之用意。
至元十四年(1277年)七月，蒲壽庚任鎮國上將軍、江西行省參知政事(因張世傑回師圍城，沒有赴任)。
至元十四年(1277年)七月，南宋·張世傑從潮州回師泉州，“欲得蒲壽庚而甘心”，與義軍陳吊眼、畲族許夫人等協力討蒲壽庚，聲勢浩大。這是一場關係到蒲氏及其家族命運的生死決戰，但當時元軍主力不在泉州，守城兵力單薄，城內又有宋朝遺民內應，形勢對蒲壽庚極其不利。蒲壽庚一方面派遣孫勝夫詣杭州求援兵，一方面與尤永賢、王與、金泳等部將“協謀拒守”，“晨夜血戰”。十月，張世傑圍泉州城70多天(首尾3個月)後，因元·元帥唆都等來援，被迫解泉州圍南撤，復返廣東。這場保衛戰的勝利，沉重打擊了殘宋的士氣和力量，基本上消除了閩南地區反覆拉鋸的局面，鞏固了元朝在福建的統治。
至元十五年(1278年)三月，蒲壽庚任福建行省參知政事。八月，蒲壽庚任福建行省中書左丞，“鎮撫瀕海諸郡”。
至元十六年(1279年)二月，蒲壽庚的舟師奉旨配合元軍主力進擊廣東，“會追二王”，張世傑遺於崖山，幼主祥興帝赴海死，宋亡。
至元二十一年(1284年)八月，蒲壽庚任江淮等處行省中書左丞兼泉州分省平章政事。
蒲壽庚對那些雖然懷舊但沒有參與抗元鬥爭的宋朝故臣頗注意籠絡。如推舉原吉安知州莊彌邵、原刑部郎中莊彌大分別爲肇慶路治中和廣州路治中;對那些因故倖免的宋室宗子後來也不再追究，甚至還授錄爲官。這種策略對穩定局勢、鞏固統治起了積極作用。
蒲壽庚於宋元轉變之際，顯赫一時，其子孫在元朝，亦頗得志。按蒲壽庚三子：師文(參見《泉州人名錄·蒲師文》)、師斯、均文。師文於至元十八年(1281年)，嘗兼任提舉福建道市舶，且以功襲職，官爲福建平海行中書省。師斯子崇謨，官至行省平章政事。
死後鞭屍
作爲曾經的泉州市舶司提舉、同時也是泉州首屈一指的富豪，此時的蒲壽庚作古早已百年以上，卻被明朝人從墳墓裏拖出來“鞭屍三百”。他的蒲氏後人更被朱元璋指爲“餘孽”，全部充軍禁錮，並被要求不得讀書，“世世無得登仕籍”。
