戰爭經過
日軍計劃
1944年12月美軍佔領萊特島後，盟軍西南太平洋戰區總司令道格拉斯·麥克阿瑟命令第6集團軍和第8集團軍一部共28萬人在呂宋島登陸，殲滅駐菲律賓日軍主力。日軍在呂宋島駐有陸、海軍28.7萬人，由第14方面軍司令山下奉文上將統一指揮;呂宋島的日軍既沒有能夠摧毀美軍坦克的武器，又沒有飛機，因而不指望決戰，決心以持久防禦牽制和消耗美軍，計劃以一個師在林加延灣沿岸組織防禦，以方面軍主力15萬人編成尚武集團，防守北呂宋地區;以第1挺進集團等部3萬人編成建武集團守衛中呂宋克拉克以西地區;以第8師等部10萬人編成振武集團，扼守南呂宋馬尼拉以東地區。
美軍登陸
根據計劃，登陸行動將在1945年1月9日展開，代號爲S日，日軍報告超過70艘盟軍艦艇集結在仁牙因灣。美第6集團軍，轄第1、第14軍，約20萬人在作戰艦艇233艘、運輸船隻800艘和飛機1000架支援下，在呂宋島西岸林加延灣登陸。登陸前的炮火準備在早上7時開始，一小時後，登陸行動正式展開，登陸部隊遭到日軍神風特攻隊的頑強抵抗，奧曼尼灣號護航航空母艦被一架神風特攻飛機擊毀，同時一艘驅逐艦及數艘其它軍艦被擊沉，第3艦隊的艦載機對登陸部隊提供密接空中支援，猛烈炮轟及轟炸日軍大炮據點。
在仁牙因灣登陸的部隊是由沃爾特·克魯格陸軍中將指揮的美國第6軍團，數天內第6軍團大約175,000名士兵在沿20公里的海灘登陸，美國第1軍負責掩護其側翼，而由奧斯卡·格利斯沃德率領的美國第14軍則向南進攻馬尼拉，雖然克魯格十分擔心日軍攻擊他毫無掩護的東翼，但日軍沒有這樣做，克拉克山區的建武集團因缺乏御防準備，很快便被趕進深山。而美軍直到一月23日到達克拉克空軍基地前沒有遇到強大的抵抗，攻取基地的戰役直至1月底，攻佔該基地後，第14軍繼續向馬尼拉推進。
爲攻佔馬尼拉，1945年1月31日，美軍第11空降師的兩個團實施空降行動，攻佔一座橋樑及之後向馬尼拉前進，爲儘快攻佔馬尼拉，美國第8集團軍第11軍和第11空降師分別在蘇比克灣西北和馬尼拉灣以南兩個地段登陸，對馬尼拉形成夾擊態勢。
爭奪首都
對第14方面軍來說，如何對待首都馬尼拉，是呂宋島防禦上的一個問題。其一般方針是，不在馬尼拉設戰場，部隊撤離市區，軍需物資送往各據點。但海軍和航空部隊堅持死守馬尼拉，因而在執行中不夠堅決徹底。2月3日，美軍第11空降師的傘兵奇襲馬尼拉市，在這個擁有70萬人口的菲律賓首都同日軍展開了長達4個星期的激烈巷戰。日軍守衛馬尼拉的海軍部隊憑藉市中心堅固的建築物進行抵抗，但美軍用猛烈的炮火摧毀了一座座建築。3月3目，麥克阿瑟宣告馬尼拉徹底解放，這場戰鬥使馬尼拉市中心成爲一片廢墟。
山區戰鬥
島上日軍第14方面軍司令山下奉文陸軍大將已命令其部隊當美軍進入市內時破壞所有橋樑及其基礎設施，又挖掘壕溝以阻止美軍前進，麥克阿瑟在同一天宣佈即將收復馬尼拉，2月11日，第11空降師攻佔日軍在外圍最後一個據點，因此包圍整座城市，美軍及菲律賓軍在隨後數星期在市內進行掃蕩行動。3月3日，美軍佔領馬尼拉，隨後向呂宋島西南和東南部進攻。
尚武集團把富饒的稻米產地卡加延河谷作爲根據地，以碧瑤以西至聖何塞以北一帶山地作爲南面的屏障，自西向東依次部署了第19師、第58獨立混成旅、第23師、第2坦克師以及第10師等部隊，以抵禦美第1軍(美軍5個師、美菲軍1個師)的猛烈攻擊，特別是在巴列特，撒拉克撒克山埡口展開了激戰，美軍用推土機在險峻的山地中開闢道路，向前推進坦克和重型火炮，以壓倒之勢攻擊日軍。4月下旬，碧瑤失守。6月，美軍進入卡加延河谷，6月下旬完全打通了阿帕裏至碧瑤和阿帕裏至聖何塞的兩條道路。此後，日軍被攆入深山，在飢餓和疾病的折磨下進行持久戰。指揮馬尼拉海軍防衛部隊的振武集團在救援作戰中失敗，又於2月底受到美第14軍的攻擊，被追陸續退入山中。這支部隊5月1日起改稱第41集團軍，但到6月底已經喪失了有組織作戰能力。但仍堅持抵抗，餘部直至日本投降後才放下武器。此役，美軍損失4.7萬人、艦艇17艘;日軍亡21萬人。(日本投降時山下奉文直轄的尚武集團15.2萬人，剩下5.5萬，橫山靜雄的振武集團10.5萬人，剩下1.25萬人。冢田理喜智中將的建武集團3萬人剩下1300人)。
