按照常理來說，進入後宮的女子就等於嫁進了後宮，便是皇帝的妻妾，夫妻之間居住在一起應該是很正常的事情。但是事實上，清朝皇帝與妃嬪們是不能同房居住的。
清朝皇宮的規矩十分嚴格，即使是皇帝與皇后，也只是新婚時在坤寧宮東暖閣洞房同住三天，然後必須各自回自己的寢宮居住。至於其他的妃嬪，就更加不能與皇帝同住了。
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因爲在之前的歷朝歷代，有不少皇帝就因沉湎於女色而荒廢了朝政。明朝嘉靖時期，後宮中甚至還發生過宮女險些勒死皇帝的事件。
清朝吸取了歷史的教訓，在傳宗接代的同時，最大程度確保皇帝的安全和健康。所以，在關外的時候，就已經開始奉行皇帝不得迷戀女色的訓誡。到順治入關之後，更是進一步加強了對於後宮的管理。皇帝與妃嬪們都有各自的寢宮、膳房等，一般情況下是不可以同桌吃飯的，並且嚴禁皇帝與妃嬪同居一室。
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當皇帝需要行幸時，敬事房總管太監會事先把寫有妃嬪姓名的“綠頭牌”擺好，以供皇帝選擇。被皇帝“翻牌”的妃嬪得到通知後，要將衣服脫光，香湯沐浴淨身，用毯子把身體包裹住，由太監背到皇帝的寢宮。然後從皇帝腳下輕輕掀起被子的一角，裸身匍匐着鑽進去。待完事後，仍由皇帝腳下慢慢倒着爬出被子。這樣做是出於安全的考慮，防止妃嬪攜帶暗器進入皇帝的寢宮。
妃嬪在皇帝寢宮停留的時間也是有限制的，絕不允許與皇帝一起過夜。爲了避免皇帝縱慾過度發生意外，到了一定的時間，太監便會在窗外高聲喊：“是時候了!”連喊三聲後，不管皇帝有多麼不捨，都必須要傳太監進屋將妃嬪揹走。
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“咸豐六(1856)春，奕詝帝住孝欽(慈禧)處數日，不視朝。孝貞(慈安)諗其故，乃頂祖訓至宮正跪，命人請皇帝起聽訓。奕詝帝制止說：‘予即聽朝，勿通訓。’迨出朝，少時即退。問後何在，告之在坤寧宮。奕詝帝即至，見孝貞於中坐，孝欽跪在地下，孝貞歷數其過，用杖辱之”(《清稗類鈔》)。
根據上面這段記載可以得知，清朝皇帝與妃嬪不能同居的規矩是非常嚴格的。皇帝若是違反了，皇后可以借“祖訓”之名進行勸諫，皇帝是不能反駁的。而且皇后作爲中宮，還有權處罰違反“祖訓”的妃嬪。
