清軍的主要得失一是軍事鬥爭與外交鬥爭相互配合，鬥爭有理、有利、有節。面對沙俄軍隊對中國黑龍江流域的不斷侵略和蠶食，康熙帝本着先禮後兵的原則，曾多次與沙俄進行交涉，堅決要求沙俄軍隊停止侵略行徑。當外交手段未能奏效時，才使用武力驅逐入侵者。
待軍事上取得勝利之後，又通過外交手段來鞏固軍事鬥爭的勝利成果，使這場捍衛領土主權的鬥爭開展得有理有利有節，最終使沙俄不得不撤出雅克薩，承認中國在黑龍江流域的領土主權。由於這場鬥爭的性質是正義的，因而得到了黑龍江流域地區各族人民的大力支持，軍民同仇敵愾，士氣高昂，爲戰爭的勝利提供了可靠的保障。
二是善於把握戰機。沙俄侵佔雅克薩，正是清廷忙於平定三藩之亂，無暇顧他之時，於是康熙帝暫時放棄使用武力，轉而採取外交手段解決。待三藩平定後第2年，康熙帝即將以武力驅逐沙俄侵略者的問題提上議程，並在做好充分準備的基礎上，先後兩次出兵雅克薩，對入侵者給予了嚴厲的懲罰。後來衛拉特蒙古準噶爾部首領噶爾丹發動叛亂，清廷爲避免兩面作戰，及時與沙俄簽訂了《中俄尼布楚條約》，從而結束了戰爭，以便有精力對付噶爾丹叛亂。
三是作戰中善於揚長避短。清軍根據侵佔雅克薩的沙俄軍隊城堅炮利、但人數較少的特點，以及清軍火器較弱，但人數較多的情況，主動揚長避短，不急於在敵炮火下發動強攻，而是在城周圍挖壕，斷其外援，作長期圍困，使其炮火優勢無從發揮，1年後糧彈消耗殆盡，因餓、病和作戰而死者佔90%以上。沙沙俄侵略軍雖然選擇了清朝三藩之亂的有利時機侵佔雅克薩，而且又有城堅炮利等軍事優勢，但由於他們所進行的戰爭是非正義的侵略戰爭，因而遭到當地人民堅決反抗，加之沙俄侵略軍入侵戰線拉得過長，補給和後援都難於保障，很快就陷於四面楚歌的境地，失敗也就成爲其在所難免的結局。
雅克薩之戰是中國清代對外戰爭的一次重大勝利，以下是大學教科書《中國古代史(下)》某版本的原文節選：
“雅克薩反擊戰... 在沙俄軍隊遭受重創、守城士兵只殘存幾十人、雅克薩城旦夕可下的情況下，沙俄被迫同意和談。清康熙二十八年，中俄雙方於尼布楚正式談判。鑑於當時西北地區準噶爾部噶爾丹配合沙俄侵擾喀爾喀蒙古，割據叛亂勢力十分猖獗，爲避免兩線作戰，集中精力平定準噶爾，康熙指示談判代表做出讓步。而俄羅斯因軍事上未能得逞，加上遠征克里米亞失敗，戰線過長，竭力想保持既得侵略權益，也不得不做出相應妥協。雙方簽訂《中俄尼布楚條約》，規定兩國東段邊界以格爾必齊河、外興安嶺和額爾古納河爲分界線，從法律上肯定了黑龍江流域和烏蘇里江流域廣大地區屬於中國領土，拆除俄國在雅克薩和額爾古納河南岸修築的據點，撤出侵入的軍隊。清前期簽訂的中俄條約屬於平等條約，具有重大的歷史意義。”
