箱館戰爭(日語:箱館戦爭)是日本戊辰戰爭中的一場戰役,也是明治新政府軍和舊幕府軍之間的最後一戰。
發生時間是1868年12月4日─1869年6月27日(即舊曆明治元年10月21日 - 明治2年5月18日)。因榎本武揚等人的投降,舊幕府勢力的抵抗完全結束,戊辰戰爭宣告終結。