秦曼雲是山東濟南人，其兄長就是著名的革命烈士秦茂軒。秦曼雲的第一任丈夫是我黨第一代領袖人物關嚮應，兩人於1928年6月在莫斯科中山大學結婚，數年後分道揚鑣。後來，秦曼雲又嫁給了曾是我黨重要領導人後爲叛徒的盛忠亮，
1934年6月26日午後6點，中共上海中央局書記李竹聲在與共產國際代表接頭後回到中央局的辦公處，被守在門口的國民黨中統上海行動區的特務逮捕，同時被捕的還有辦公處的工作人員秦曼雲、仇愛貞，以及中央局祕書處的負責人李德釗和交通員周惠年等。中共江蘇省機關隨即被破獲，書記趙立人和全總黨團書記袁孟超等也遭逮捕。秦曼雲被捕後也隨即成爲叛徒(一說秦曼雲後經保釋出獄，但從此與中共脫離組織關係)。
李竹聲亦在被捕後叛變，供出了中共在上海和蘇區的許多機密，如中央紅軍的兵力和作戰計劃，以及上海中央局的電臺位置等，接着他又供出了中共另一位重要領導人盛忠亮的祕密住址，盛忠亮隨即在法租界被捕。
盛忠亮爲中共中央委員，此前擔任中央上海中央局宣傳部長，李竹聲被捕後，他接任了中共中央上海局書記。
盛忠亮在被捕之後曾在受審時大有一副堅貞不屈的架勢，敵人從他嘴裏很難搞到什麼有價值的東西。無奈之下，國民黨特務只好向已成叛徒的顧順章求教。
顧順章曾是中共祕密組織中央特科的負責人。1931年被捕後投降國民政府，由於其掌握大量共產黨的核心機密，對黨危害，被稱爲“中共歷史上最危險的叛徒”。顧順章對盛忠亮於秦曼雲都瞭解，於是獻上妙計——盛忠亮對女友秦曼雲言聽計從，可從秦曼雲處下手。
國民黨當局立即將秦曼雲押解至上海，盛忠亮在秦曼雲的誘導下可恥叛變，後兩人結婚。
盛忠亮叛變後進入國民黨中央黨部社會科工作，當了中統特務。
1949年國民黨敗退大陸，盛忠亮、秦曼雲隨着蔣介石軍事集團到了臺灣，盛忠亮曾擔任臺灣“外交部”亞西司司長、駐烏拉圭全權公使。
1964年，秦曼雲與辭職之後的盛忠亮攜五個子女舉家遷居美國經商，賺了不少錢。
秦曼雲在晚年曾多次回國觀光，還作爲“愛國華僑”應邀參加過國慶觀禮。
1981年，秦曼雲首次回國，多次向有關部門請求，想見見當年莫斯科的老同學，組織上安排王鶴壽會見。
王鶴壽時任中央委員、中央紀律檢查委員會副書記，他1926年在莫斯科東方大學讀書時與秦曼雲是同學。
關於這次會見，陶鑄的女兒陶斯亮在《我與乾爸爸王鶴壽》一文中有詳盡的描述：組織上安排乾爸前往探望，但他不想一個人面對有如此複雜歷史的人，所以就拉上了我。這是一次讓我終身難忘的會見。房門打開後，我眼前出現的儼然是一位闊太太。雖然已70高齡，依然化着濃妝，上着鮮豔綢衫，下穿綠喇叭褲，尖尖的高跟鞋、佩帶着項鍊和耳環。老太太首先打聽當年東方大學同學們的下落、境況，乾爸簡短的回答平靜的敘述分外感人肺腑。老太太面帶愧色，神情很不自然。她吞吐地陳述了1927年被捕的經過，極力爲自己的變節行爲開脫;她從側面，卻又不無真誠地詢問了關嚮應同志死難的經過;她還表示，爲了祖國的統一大業，願意爲共產黨盡力效勞。最後，她以同情的口吻問：“這幾年來，你受苦了吧?”乾爸始終神態自若地靠在沙發上，搖着一柄紙摺扇，聽到這話，坦然地一笑：“這是我們黨內自己的事情，算不了什麼!”一句話，說得老太太頓時無言以對。
陶斯亮還感慨地寫道：我望着這兩位走過半個世紀再度重逢的老人，心情極不平靜。乾爸爸，舊衣布鞋，滿頭飛雪，神情冷峻，一望便知是歷盡滄桑之人。他解放前曾6次被捕入獄，表現出一個共產黨員堅貞不屈的氣節。“文化大革命”期間，在叛徒、走資派等罪名下，被批鬥573場，關押達10年之久，受盡肉體的折磨和精神的凌辱，但他對信仰從未動搖過、意志從未消沉過、自信也從未喪失過。
1986年秋，秦曼雲回國探親時專程去延安參觀了關嚮應故居，並瞻仰了關嚮應的陵墓。
2001年12月17日，秦曼雲在美國去世，享年93歲。
