關於李斯的能力，單單從一篇上秦王嬴政的《諫逐客書》，就可堪稱歷史最佳政論文，尤其是以下一段：“臣聞地廣者粟多，國大者人衆，兵強則士勇。是以泰山不讓土壤，故能成其大;河海不擇細流，故能就其深……今乃棄黔首以資敵國，卻賓客以業諸侯，使天下之士退而不敢西向，裹足不入秦，此所謂‘藉寇兵而齎盜糧’者也。”
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其治國理念、用人胸懷、富國謀略、卻敵技巧，盡在其中矣。就能力上而言，李斯足當“亂世之能臣，治世之幹吏”。然而，這樣一位厲害的治國能手，後來怎麼就被趙高給算計了，落得個梟首、夷族的悲慘結局呢?
究其原因：一是李斯不該被趙高蠱惑改詔立胡亥，因爲胡亥當了皇帝后，趙高以主謀而功勞第一，地位自然也是第一，李斯在新朝的地位便下降於趙高之後;二是李斯這個人更多地關注於治國理政，對於同僚間的權謀和傾軋關注得少，沒有警覺和防範之心;三是趙高長期在帝王身邊服務，善於揣摩和算計，善於“窩裏鬥”，其佈局之周密、算計之精準、手段之狠毒，足以“傲視古今”。比如，他收拾李斯，便只幾個回合就將李斯打入了地獄。
胡亥當上皇帝后，幾乎不理政事，任由趙高把持朝政。但因李斯擋在其間，有些礙手礙腳，加上當起義四起之時，李斯建議胡亥用重典，嚴刑罰，他擔心李斯藉此可能會收拾自己，決定先下手爲強。一天，趙高拜見李斯，嘆息說盜賊紛起，告急不斷，皇帝卻一味玩樂，你作爲丞相，應該進言。
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李斯覺得很對，只是皇帝居於深宮，除了你誰也不見，如何能見到皇帝呢?趙高忙說，只要皇上得空，我立馬向你報告。但趙高並未向胡亥報告李斯要進見，他三番五次說胡亥要接見李斯，當李斯去宮中後，胡亥屢屢拒見，後來甚至爲此怪罪李斯。這爲後來下手，埋下伏筆。
在胡亥對李斯產生不好的印象後，趙高順勢進讒言，說沙丘矯詔，李斯雖參與了謀劃，但期望封王，沒能實現願望，有謀反動向。陳勝與李斯的家鄉不遠，陳勝叛亂後，李斯的兒子李由作爲三川郡的將領卻不去剿滅，這是他們謀反的證據。必須速除李斯。
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鑑於李斯畢竟曾經是功臣，胡亥沒有操切，先派人到三川郡去調查李由。爲此，趙高特意召見去調查的官員，作特別交待。
欲加之罪，自然就順理成章了。李斯被下獄，屈打成招。最後，李斯被推出市曹，刺字、割鼻、梟首，落得個碎屍萬段的下場。
