民間傳說和很多史料都說張獻忠在四川建立大西政權期間殺了成千上萬的四川人，導致了清朝時期的“湖廣大移民”。持此觀點的人都是源於一本叫《蜀碧》的書。其作者彭遵泗是乾隆二年(1736年)的進士，官爲御林院編修，也就是說專門給皇帝寫書的。按照儒家主流思想農民起義一般都被稱爲寇或賊。身爲天下主人的滿清，彭遵泗不寫滿清的文治武功，寫滿清人的屠城那是絕對不可能的。出於統治階級穩定民心的考慮，彭遵泗在此書裏製造了張獻忠屠四川的僞證。
依據歷史常識來看，自古以來四川歷來就是全國統一和民族復興的根據地，秦滅六國、劉邦建立漢朝、隋統一中原，無不以四川作爲根據地而展開。身爲大西政權的領導人張獻忠不可能不知道四川的重要性，在四川建立根據地，攻可出漢中定西北，下長江定江南;退則可割據一方。
一些史料記載：1644年，張獻忠在成都建立了大西政權。張獻忠建國之後的施政，卻不是大開殺戒，而是拼命招徠四川的人才，併發布“三年不徵錢糧”的命令作爲政治號召。建國二年後局勢未穩，滿清在1646年正月就已發出征討張獻忠的詔書並派兵入川。在大軍壓境，生存都難有保障的情形下，張獻忠不去抗擊清軍，反倒去屠殺散居在四川各地的平民百姓，這可能嗎?就算張獻忠愚蠢至極，把六百萬四川人殺得只剩下七八萬人，這何以能夠抵擋清軍侵略?如果說張獻忠的大西政權主張屠殺四川人，真的沒有理由。
但滿清人就不同，滿清有足夠的理由屠川，其一，殺四川人以立威，讓皇權震懾民衆，不敢反抗，因爲四川人富有血性，不屈不撓;其二，殺人滅口，斬草除根，歷史上有名的文字獄正是在這樣的背景下產生的，不難看出清軍屠殺四川已是蓄謀已久。
根據現有掌握的材料，滿清在四川大規模的屠殺破壞共有三次。第一次是順治三年(1646年)肅親王豪格領兵進入四川，鎮壓張獻忠的大西軍及南明各地方武裝。豪格率領清軍入川后第一仗就是在大西叛將劉進忠的引導下，於西充襲殺張獻忠。有關張獻忠被襲殺後清軍的行動，王先謙在《東華錄》如是記載“復分兵四出，破賊營一百三十餘處，斬首數萬級”，依據這則史料多數治史者認爲清軍殺的“數萬級”都是大西將士。然而在《清史稿》中卻有不同的記載：“抵西充，大破之，豪格親射獻忠，殪，平其壘百三十餘所，斬首數萬級。”這樣來說清軍對待四川的軍民是一律斬殺。
康熙三年(1664年)，清軍鎮壓夔東十三家義軍是對四川平民的第二次大規模殺戮。清軍在擊敗四川起義軍後，竟採取類似後來日軍三光的方式，派出大批兵丁“四山搜剿”，用他們自己的話來說就是“掃穴無遺類”。事後滿清四川總督李國英上疏說“數萬巨寇，……無一漏網”。清軍所到之處殺人成魔。
相比前兩次，清軍第三次屠川更爲嚴重，得到了滿清統治者的慫恿。康熙十二年(1673年)到康熙二十年(1681年)。先是吳三桂軍攻入四川大肆破壞，如譚宏部“宏兵絡繹不絕，勒索居民，十室九空，或涉深山窮谷人跡罕到之地，尚不得免，……生靈塗炭，怨聲滿路。”又如何德部“徵調煩苛，怨愁之氣，釀成瘟疫，上南之人，死亡甚衆。”聯繫當時的時代背景，在滿清征服中國的過程中，始終伴隨着對廣大中國平民的瘋狂殺戮。其中比較典型的屠殺事件如令人毛骨悚然的“揚州十日”“嘉定三屠”“廣州大屠殺”“江陰八十一日”等大規模殺戮。此外，滿清軍隊還在其他很多地方也進行了慘絕人寰的屠殺。魯迅說過：“滿清殺盡了漢人的骨氣廉恥。”
但是，在梓潼七曲山大廟內，至今卻有一座張獻忠家廟。據說大西王張獻忠死後，當地人爲寄託懷念之情，於七曲山風洞樓上，爲他塑像，綠袍金臉，甚爲威武，香火不絕。梓潼人出於對大西王的崇敬，稱七曲山張獻忠家廟曰“太廟”，爲遮避耳目，又稱“大廟”。後來，乾隆初年此廟曾經遭地方官毀像。其後，又有人重塑張獻忠像，但又被官方搗毀。幾經反覆，如今的塑像，是近年才重塑的。
