清收復新疆之戰是晚清欽差大臣左宗棠統帥清軍，消滅侵佔新疆的阿古柏勢力、維護中國主權和領土完整的戰爭，又稱左宗棠收復新疆。
歷史背景
第二次鴉片戰爭之前，沙皇俄國就已侵佔了中國西北部的齋桑湖地區和浩罕、布哈拉等中亞小汗國的大片地區。趁第二次鴉片戰爭中國處於劣勢的境況，沙俄出兵佔領了中國的巴爾喀什湖東南的塔拉塔勒河、伊犁河等七河地區，迫使中國清政府簽訂了《中俄伊犁塔爾巴哈臺通商章程》，沙俄得到了在伊犁、塔城地區的通商、貿易免稅、自由居住、傳教等特權。
1864年，沙俄再與清政府簽訂《中俄勘分西北界約記》，沙俄成功取得伊塞克湖和巴爾喀什湖以東以南地區。
此時正值太平天國運動和同治陝甘回變波及新疆，新疆各地豪強趁機而起，出現了割據紛爭，各自爲王的混亂局面。喀什噶爾由伊斯蘭教白山派首領馬木提艾來木佔據稱王。不久，柯爾克孜族部落欽察頭目司迪克聯絡回族封建主金相印，在混亂中奪取了喀什噶爾稱王，趕跑了馬木提艾來木。馬木提艾來木致書中亞的浩罕汗國，欲藉助外部勢力驅逐司迪克。司迪克也派出金相印親自到浩罕進行聯繫，想把流亡浩罕的黑山派和卓後裔布素魯克請回喀什噶爾，對抗馬木提艾來木。1865年春，浩罕汗國派軍事頭目阿古柏護送布素魯克去見司迪克。
阿古柏和布素魯克一到喀什噶爾立刻組織兵變趕走了司迪克，於1865年底以喀什噶爾爲中心，成立了“哲德沙爾汗國”政權。1867年，阿古柏拋開布素魯克自行建立“洪福汗國”一統南疆。1870年，阿古柏攻佔了吐魯番，切斷了北疆和河西走廊之間的聯繫，並收降了以白彥虎爲首的陝甘回軍殘部，實力進一步增強。到1871年底，迪化、瑪納斯、鄯善先後被阿古柏攻克。同年俄國出兵佔領伊犁。這樣，清軍除塔城、烏蘇等少數據點外，已經被迫全部從新疆撤退。
戰爭過程
戰前清軍的準備
同治十一年(1872年)七月，清廷尚在爭論征伐阿古柏之事，左宗棠認爲“既事關君國，兼涉中外，不能將就了局，且索性幹去而已”，率所部湘軍進駐蘭州，準備收復新疆。
左宗棠的準備工作做得非常專業和充足。他採用“緩進急戰”的策略。“緩進”，就是用一年半的時間籌措軍餉，積草屯糧，整頓軍隊，減少冗員，增強了軍隊的戰鬥力。即使是自己的主力湘軍，也剔除空額，汰弱留強。他還規定，凡是不願出關西征的，一律給資，遣送回籍，不加勉強。留下來自願出關的部隊，是一支士氣高漲的精兵。“急戰”，就是考慮國庫空虛，爲了緊縮軍費開支，大軍一旦出發，必須速戰速決，力爭在一年半左右獲取全勝儘早收兵。左宗棠在深入調查及詳細計算後，估算出全部軍費開支共需白銀八百萬兩。爲防止意外，做到留有餘地，他向朝廷申報一千萬兩，當時主管財政的大臣沈葆禎一見西征軍費的預算報告，就想攤派給各省，從地方財政收入裏抽調，可是這樣一來就很難一時湊齊，會貽誤戰機。軍機大臣文祥過問了這件事，他親自去找皇帝和攝政的西太后陳述利害關係。皇帝御批道：“宗棠乃社稷大臣，此次西征以國事而自任，只要邊地安寧，朝廷何惜千萬金，可從國庫撥款五百萬，並敕令允其自借外國債五百萬。”
左宗棠同時在蘭州建立“蘭州製造局”(亦稱“甘肅製造局”)，爲西征軍修造槍炮。爲了對付阿古柏軍的洋槍洋炮，左宗棠從廣州、浙江調來專家和熟練工人，在蘭州造出大量先進武器，還仿造了德國的螺絲炮和後膛七響槍，改造了中國的劈山炮和廣東無殼擡槍。新疆收復後，上海“泰來洋行”的德國技師福克曾在哈密與左宗棠會面，觀看了部隊的演練，見湘軍紀律嚴明，操練得法，軍火槍炮也不落後，於是感慨地說：“清軍若與俄國交戰於伊犁，必獲全勝。”當然了這種說法只可一聽，甲午戰爭前大部分西方觀察者都認爲中國將獲勝。左宗棠同時又建“甘肅織呢總局”(亦稱“蘭州機器織呢局”)，這是中國第一個機器紡織廠。
光緒元年(1875年)，朝廷上爭議出兵收復新疆，引起“海防”與“塞防”之爭。李鴻章等主張放棄塞防，將“停撤之餉，即勻作海防之餉”。左宗棠力表異議，指出西北“自撤藩籬，則我退寸而寇進尺”，尤其招致英、俄滲透。李鴻章等認爲：自從乾隆年間平定新疆一百多年以來，每年都要花費數百萬兩餉銀，這是一個填不滿的無底洞，現在又要竭盡天下的財力去贍養大軍西征，還不如依從英國人提出的條件，允許阿古柏政權獨立，只要他答應稱臣入貢就是了。左宗棠則全力反駁李鴻章，他認爲：如果丟失新疆，則這塊土地不是被西方的英國勢力所控制，就是被北方的沙皇俄國鯨吞，中國隨即失去西北邊防的關卡要塞和重鎮，使西北邊防無以屏障，到時中國邊防的兵力不但不能削減，反而會大大增加。從全局來看，不戰而丟新疆的後果，對內必將嚴重有損國威，喪失民心;對外也必將助長列強的侵略氣焰，不利於海防。所以李鴻章的主張乃是誤國之計，絕不可行。當時的軍機大臣文祥被左宗棠所說服，全力支持之：“老臣以爲宗棠之言深謀遠慮，上承先皇高宗之遺志，下惠子孫萬代，請陛下決策。”於是光緒皇帝和攝政的西太后下詔授左宗棠爲欽差大臣，全權節制三軍，以將軍金順爲副帥，擇機出塞平叛新疆。
左宗棠的收復新疆戰略是先攻北疆的烏魯木齊：“關內關外用兵雖有次第，然謀篇佈局須一氣爲之。以大局論，關內肅清，總督應移駐肅州，調度軍食以規烏魯木齊。烏魯克復，總督應進駐巴里坤以規伊犁。”。他指出，要提防“俄人狡謀”，必先安定新疆回部，“欲收伊犁，必先克烏魯木齊”。如果烏魯木齊城克服，“我威維揚”，再大興屯田以保證長期後勤供應，安撫新疆各部族耕牧如常。如此，“即不遽索伊犁，而已穩然不可犯矣。烏城形勢既固，然後明示以伊犁我之疆索，尺寸不可讓人”。在戰術上，左宗棠也精心分析：“俄雖國大兵強，難與角力，然苟相安無事，固以度外置之。至理喻勢禁皆窮，自有不得已而用兵之日，如果整齊隊伍，嚴明紀律，精求槍炮，統以能將，豈必不能轉弱爲強，至此勞師襲遠之寇乎?”因此，“不在先索伊犁，而在急取烏魯木齊。”左宗棠事先命西征軍前鋒部隊統帥張曜，駐軍哈密興修水利、屯田積穀。1876年一年就收穫糧食五千一百六十餘石，基本上可以解決該部半年軍糧所需。爲運輸軍糧，左宗棠又建立了三條路線：一是從甘肅河西採購軍糧，出嘉峪關，過玉門，運至新疆的哈密，二是由包頭、歸化經蒙古草原運至新疆巴里坤或古城(今奇台)，三是從寧夏經蒙古草原運至巴里坤。
阿古柏的外援
英國駐印度總督派印度康格拉茶園主英國人羅伯特·沙敖到喀什噶爾，援建阿古柏一座兵工廠，並贈送大量武器彈藥。同治十一年(1873年)，英國使團到喀什噶爾，向阿古柏送交了維多利亞女王的親筆信與各種贈品，其中包括各種槍支和二門小炮，並於次年簽訂出賣中國的《英阿條約》(《英國─喀什噶爾條約》)。沙俄則派出索莫夫與莫羅佐夫兄弟的兩支商隊，自吐爾尕特山口運送大批軍火到喀什噶爾，交阿古柏軍隊使用。1875年，英國人從印度給阿古柏一次運去連發槍2.2萬支(一說2,200支)，山炮8門，炮彈2000發。希望阿古柏作爲自己對抗沙俄的棋子。
阿古柏外甥阿吉托拉(亦名賽義德·阿古柏)、喀孜汗土烈去彼得堡面見沙皇道謝，在1873年返回時又到了奧斯曼帝國，表示願意附屬，贈送綢緞、蒙古馬、哈薩克的好馬各九匹。土耳其蘇丹阿卜杜勒-阿齊茲一世是泛突厥主義者，他隆重地接待了阿古柏派去的代表團，並賞給阿古柏“米拉胡爾巴什”(即埃米爾，國王的意思)的職銜。土耳其給阿古柏派遣了上校司馬衣艾柯克、艾裏卡孜木和木拉提伯克等二十多個高級軍事人員和政治顧問，並帶來了許多武器和禮品。顧問中有七人留在阿古柏身邊常任參謀職務。阿卜杜勒-阿齊茲一世答應阿古柏，在他之後，王位由自己的兒子世襲。特頒古蘭經一卷、奧斯曼帝國國旗一面及其他贈品多種。1875年阿古柏從土耳其一次購得新式步槍1.2萬支，火炮8門。
清軍收復北疆
到1876年4月出兵時，左宗棠指揮的西征軍有劉錦棠所部湘軍25個營，張曜所部14個營和徐佔彪所部蜀軍5個營，包括原在新疆各個據點的清軍，共有馬、步、炮軍一百五十餘營，兵力總數近八萬人。但真正開往前線作戰的只有五十餘營，二萬多人。行軍期間要經過著名的莫賀延磧大沙漠，流沙數百里，水源缺乏，唯有把部隊分批分期地行進。左宗棠坐鎮肅州(今甘肅酒泉)，命劉錦棠、金順分兵兩路，先後率師出關。他把大軍分作千人一隊，隔日進發一隊，劉錦棠走北路，金順走南路，到哈密會齊。劉錦棠率領西征軍主力自肅州入新，至哈密行程約1700裏，很順利地進入哈密。部隊各營到達哈密後，把從肅州等地陸續運往哈密的軍糧再輾轉搬運，翻過東天山九曲險道，分運至巴里坤和古城(今奇台)的金順部。很快，劉錦棠的前鋒部隊，已佔據了距離烏魯木齊只有不足三百里的濟木薩(今吉木薩爾縣)。
阿古柏獲曉清軍西進的消息後，忙令馬人得、馬明、白彥虎等分守烏魯木齊等北疆要地，阻擊清軍;其主力2萬餘人部署在吐魯番和托克遜，阿古柏則坐陣托克遜督戰。
8月上旬，劉錦棠、金順二部迫近烏魯木齊北面重地古牧地(今米泉)。清除敵軍外圍據點後，用開花大炮轟塌城牆，8月17日，清軍從缺口攻入城內，經過數天激戰，佔領了古牧地。隨後清軍乘勝追剿，收復了烏魯木齊。叛軍二號首領白彥虎逃到托克遜。金順繼續率軍西進，昌吉、呼圖壁和瑪納斯北城的守敵聞風而逃，9月初，金順部隊攻打瑪納斯南城，久攻不克。後來劉錦棠、伊犁將軍榮全先後率兵增援，於11月6日攻克該城。至此，清軍收復了天山以北的全部阿古柏軍佔領之地。
清軍收復南疆
1877年4月14日，清軍休整了幾個月後，向南疆進軍。劉錦棠率主力從烏魯木齊南下，16日進至達阪城外圍並迅速包圍該城。4月18日，清軍在達阪城外增築炮臺。4月19日清軍開炮，並擊中敵彈藥庫，敵軍死傷很多，企圖突圍未遂，只得投降。達阪城收復。
同時，張曜部隊和徐佔彪部隊在鹽池會師後，連克騰木、克闢展、勝金臺，直逼吐魯番。4月26日，劉錦棠部隊攻克托克遜。叛軍一號首領阿古柏逃往焉耆，留下他的小兒子駐守庫爾勒爲其墊後。隨後，張曜部隊和徐佔彪部隊在羅長祐所率的湘軍的協助下收復吐魯番。此時，通往南疆的門戶大開，南疆地區紛紛起來反對阿古柏的統治。阿古柏之後神祕地飲毒酒身亡。白彥虎率領餘衆逃竄到開都河一帶。阿古柏的長子胡裏爲爭權奪位殺死其弟，率領殘部逃到喀什噶爾稱王，繼續與清軍對峙。
這時李鴻章等又使朝廷發出敕令：“廷臣聚議，西征耗費鉅款，今烏城、吐魯番既得，可以休兵。”左宗棠看罷大不以爲然，於是又上疏抗旨，據理力爭。攝政的西太后看罷他的奏章，被說服，於是才繼續新疆收復戰。此時，沙俄又和土耳其發生戰爭，金順建議乘虛襲取被沙俄霸佔的伊犁。左宗棠認爲師出無名，反遭其謗，留下不打。
9月，清軍繼續從正道向西挺進，敵守軍聞風後，放棄焉耆、喀喇沙爾和庫爾勒向西逃往庫車。10月18日，劉錦棠部隊攻克庫車，白彥虎率餘部向西逃跑。10月19日，劉錦棠繼續西進。24日，清軍克阿克蘇城。26日克烏什。至此南疆東四城收復。
清軍的進軍使西南疆四城葉爾羌(今莎車)、英吉沙爾(今英吉沙)、和闐(今和田)、喀什噶爾的守軍驚恐萬分，內部分崩離析，已降敵軍的前喀什噶爾守備何步雲亦乘機反正，率領數百滿漢兵民佔據喀什噶爾漢城。劉錦棠聞訊後，立即揮師分路前進，於12月中下旬先後收復喀什噶爾、葉爾羌、英吉沙爾、和闐。阿古柏的長子胡裏與白彥虎逃往俄國。至此，這場由英、俄兩國支持的叛亂活動乃告平息。見此情景，住在山中的布魯特(今柯爾克孜族)十四個部落，也爭相內附。除伊犁外，新疆全境被收復。
伊犁談判
1871年(同治十年)，俄軍悍然侵佔伊犁後，沙皇政府估計清廷根本無力收復新疆，曾假惺惺地表示：“俟關內肅清，烏魯木齊、瑪納斯各城克復之後，即當交還。”出乎沙俄意料，中國軍民竟在1876至1877年(光緒二年至三年)連戰告捷，除伊犁地區外，新疆淪陷區均告克復。這使沙皇政府處境十分尷尬，於是它一面指使白彥虎殘部騷擾我國邊境，力圖牽制，一面則在外交上使用手段，以攫取更多利益。1878年(光緒四年)底，清政府派崇厚爲出使俄國大臣，談判歸還伊犁問題。沙皇政府軟硬兼施，迫使崇厚簽訂了屈辱的《里瓦幾亞條約》，以喪失大片領土和賠款五百萬盧布爲代價“收回”了九座空城。消息傳到國內，輿論大譁。左宗棠也極爲憤慨，他痛斥崇厚的賣國行徑，指出：“武事不競之秋，有割地求和者矣。茲一矢未聞加遺，乃遽議捐棄要地，饜其所欲，譬猶投犬以骨，骨盡而噬仍不止。目前之患既然，異日之憂何極?此可爲嘆息痛恨者矣!”
此外，左宗棠還指出，《崇約》未經清廷批准，對中國不生效力，可以推翻。迫於輿論，清政府將崇厚治罪，判爲斬監候，拒絕批准《崇約》並改派駐英、法公使曾紀澤前往聖彼得堡重新談判，同時命左宗棠統籌兵事，爲可能的戰爭做準備。
影響
清朝在戰爭中獲勝，使一部分反叛清廷自甘陝入疆投靠阿古柏的穆斯林離開新疆，往中亞地區遷移。這次民族的遷移促成了今日的東干族的出現。另外，促成新疆建省。
