對於康熙朝的三藩之亂，以往我們有一種錯誤的認知，認爲吳三桂早有謀反之心，是蓄意叛亂，並且還認爲由於吳三桂降清，又叛清，漢族士大夫對他的人品有懷疑，所以不積極配合，所以導致三藩失敗了。下面，我們來用詳盡的史料澄清這幾個問題。
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第一：三藩叛亂實際上是被清廷逼反的
康熙帝親政後，認識到以吳三桂爲代表的三藩集團，可能會變成唐代的藩鎮，形成尾大不掉之勢，所以以三藩、河務、漕運爲三大事，書而懸於宮中柱上，表示日夜不忘這三件大事。三件大事之中，尤以三藩爲第一急務。
康熙十一年(1672年)十月，太皇太后(孝莊太后)以太宗皇太極時開疆拓土，甚重騎射，提醒康熙帝居安思危，訓練武備。《康熙王朝》裏說孝莊太后不主張撤藩，要把吳三桂拖死，等到吳三桂死了，再撤，其實是瞎說，太皇太后是積極鼓勵康熙撤藩的。
第二年，正月，清廷在北京南苑舉行大規模閱兵，軍容嚴整，威震遐邇。清廷公然向三藩炫耀武力，使得三位藩王惴惴不安。
三藩感覺自身難保，希望能夠告老還鄉。
康熙十二年(1673年)二月，尚可喜以無法管教長子尚之信嗜殺不法之行，疏請撤藩，歸老遼東，並請以其子尚之信世襲王爵。康熙帝接到奏摺，吏部討論的結果是，藩王尚存，不準世襲王爵，意思是當你死了，位置才能傳給你兒子，並下令尚可喜全藩北撤。清廷此舉，更使吳三桂、耿精忠、尚可喜三人深感不安，吳三桂、耿精忠分別於7月3日、9日上書朝廷，請求撤藩。清廷再次就三藩問題展開討論，會議的結果是耿藩全撤，但對勢力最大的吳三桂則久議不決。
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兵部尚書明珠、戶部尚書米思翰、刑部尚書莫洛爲首的少數人主張撤掉吳藩，而以大學士索額圖爲首的多數人以撤則激反爲由，主張仍由吳三桂鎮守雲南。
康熙認爲吳三桂，撤亦反，不撤亦反，不如先發制人，乃決策撤藩。撤藩令一下，吳三桂世守雲南的希望破滅，遂於當年11月21日殺害雲南巡撫朱國治等，自稱“天下都招討兵馬大元帥”，以明年爲周元年，恢復漢制，蓄髮易服，同時致書平南、靖南二藩以及貴州、湖南、陝西、四川的官員，相約共起。
從事情的經過，我們可以看出，吳三桂絕對不是先挑釁的，而是清廷決心撤藩，激反吳三桂。再說吳三桂是1612年生人，1673年已經60多歲的人了!還想當皇帝?吳三桂只是想世守雲南，並不是想當皇帝。那麼吳三桂世守雲南的想法在當時合不合清理?絕對符合，因爲清兵入關，讓吳三桂、耿精忠、尚可喜攻打南明的承諾就是讓他們當王。現在國家穩定了，清廷想撤藩了，這到底是誰先違反約定的?
第二：三藩極盛時，南邊三藩已經飲馬長江了，北邊陝西、山西已經陷落。但爲什麼還失敗了呢?
康熙十三年，吳三桂率主力，到達湖南，陳兵長江南岸，定南王孔有德的女婿孫延齡與靖南王耿精忠也先後舉旗叛亂，廣西、福建失陷，原吳三桂總兵官、陝西提督王輔臣殺莫洛，舉兵叛亂，攻陷蘭州。
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於此同時，各地漢族官員以“反清復明”的口號紛紛舉事，數月之間吳三桂佔據半壁江山，雲南、貴州、湖南、湖北、四川、福建相繼失陷，中原動搖，烽火遍及大半個中國。
此時吳三桂如果渡江北上，清廷很有可能土崩瓦解。但是他惟命諸將不得過江，有人說，吳三桂，你這不是傻嗎，怎麼錯過了大好時機?大家注意!此時吳三桂已經60多歲了，根本就沒有心思當皇帝，而且三藩叛亂成功了，他也當不了皇帝，反清復明，反清復明，將來還是朱家的人當皇帝，但你吳三桂可以找老朱家的人當傀儡啊，像劉邦、項羽一樣找楚懷王的孫子過渡一下，但是大家不要忘了，吳三桂殺害了南明永曆帝朱由榔，將來老朱家的人當了皇帝，怎麼地也要算這筆賬。所以吳三桂耗不起，不能向曹操那樣，先找漢獻帝當個擺設，權力鞏固以後，讓兒子當皇帝，況且吳三桂的兒子也死了，只剩下年幼的孫子，所以成功了，吳三桂的後人也擺平不了那麼多起義的藩王和官員。
吳三桂惟命諸將不得過江，是希望清廷能夠收回撤藩的成命，以強大的兵勢迫使清廷與其談判。但是康熙皇帝斷然拒絕了談判。堅決要撤藩，撤亦反，不撤亦反，箭在弦上，不得不發。
第三：吳三桂爲什麼會失敗?
因爲江淮等地的官員沒有起事，所以清廷能夠依靠江南的財富鎮壓三藩。清廷集中力量在湖南、江西攻打吳三桂，對其他人則採取分化瓦解的手段。各地漢族官員看見吳三桂進兵緩慢，也心生疑慮，康熙又拿出了殺手鐗，說各地官員凡是投降者，不追究叛亂的罪名，如果有功的話，還會再次被任用。於是各地漢族官員，都在觀望，當吳三桂不行的時候，大家都投降，並且還踹他一腳，這樣就有功了，不僅不會被康熙秋後算賬，還會被繼續錄用。
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吳三桂陷入四面楚歌的境地，自知無濟於事了，於康熙十七年(1678年)三月初一在衡州(今湖南衡陽)稱帝，登基大典那天，大雨如注，潦草成禮而罷。三月八日，吳三桂病死衡陽，只當了8天的皇帝，比袁世凱還悲催，袁世凱至少當了80多天啊。自知無濟於事，爲何還要稱帝，因爲古人比較講名分，所以臨死之前，吳三桂還想給自己一個名分。吳三桂一死，你想想看，後果可想而知。康熙二十年(1681年)清軍分路攻入雲南，年底攻破昆明，吳世璠自殺身亡。歷史八年的三藩叛亂結束。
三藩叛亂有沒有得到漢族士大夫的支持，有!連朝鮮都準備出兵，直搗燕京，可是當時的朝鮮國王比較謹慎，另外清廷嚴厲監視朝鮮，防止其策應三藩。等到朝鮮磨磨蹭蹭，準備妥當的時候，三藩之亂早結束了。
三藩叛亂的一個客觀的好處是，漢族官員受到重用，以前六部尚書、大學士都是滿人，康熙爲了拉攏漢人，孤立吳三桂，開始大批錄用漢族官員，提高了漢官的待遇。
漢人對於吳三桂的人品產生懷疑，主要不是其降清，當時很多人認爲吳三桂是不得以而爲之，是借師助剿，漢族士大夫討厭吳三桂是因爲他殺害了南明永曆帝朱由榔，所以三藩之亂時，大多數漢人持觀望態度，既不支持清廷，也不支持吳三桂，更不會起義。康熙看到了這一點，所以極力拉攏漢族士大夫，給予高官厚祿。還開了特科“博學鴻儒”科，開科取士，把歸隱的漢族讀書人請出來參加考試，但是大部分人拒絕應試，有的參加了考試，但故意把試卷寫得文句不通，但康熙一樣給了他們官職。
