在或許是軍事史上最大膽創新的成功突襲之後，成吉思汗進入到布哈拉，當時，他的一部分軍隊從蒙古出發，沿着直線正面攻擊算端的邊境城市;而他自己則與輜重同行，率領另一支部隊長距離遠征，這一距離比任何其他軍隊行進的路線都要長——需要穿越兩千英里的沙漠、山川及草原。
最後，他們幾乎不可思議地出現在敵方防線背後的縱深處，即便是商業旅行隊也會繞道數百英里，避開克孜勒庫姆沙漠，即傳說中的“紅沙漠”;不過這正好是成吉思汗選擇從那個方向進攻的原因，通過與那個地區的遊牧民建立良好的關係，成吉思汗得以率領他的軍隊，沿着至今仍未能確知的路線，穿越那片沙漠地帶。
他的目標布哈拉城，矗立在阿姆河一條支流兩岸的肥沃綠洲中部，那裏的居民大多數是塔吉克人或波斯人，但卻被新建立的花剌子模帝國的突厥部落所統治，花剌子模帝國是那個時代衆多短命帝國中的一個，花剌子模算端所犯的一個嚴重的致命錯誤，就是他劫掠了蒙古商隊，並把派去進行和平商業談判的蒙古大使毀容，這一行徑激怒了成吉思汗，雖已年近六十，但聽到自己的人受到攻擊時，成吉思汗毫不猶豫地召集了他那支紀律嚴明、作戰經驗豐富的部隊，再次跨上戰馬，興師問罪。
幾乎不同於歷史上任何一支重要軍隊，蒙古軍隊是輕便上陣，沒有補給供應的，即便等到最冷的月份橫跨沙漠，人和馬畜也僅需少量的水，因爲這樣的季節有露水，可以刺激部分草的生長，這些草可供牧馬，並可吸引到獵物，那是以狩獵爲生的人所需的，蒙古人不是動作緩慢地運送攻城武器和重型裝備，相反，他們帶有快速機動的工兵部隊，能當場使用可獲得的材料，建造任何他們所需的東西，在跨越廣闊的沙漠之後，蒙古人遇到第一片林子，他們就將其伐倒，製作攻城的梯子、武器及其他攻擊器械。
當先頭部隊走出沙漠，發現有第一個小部落時，快速行動的特遣部隊立即會改變速度，慢慢運行，動作遲緩，彷彿他們是來貿易的商人，而非快速攻擊的勇士，在居民們意識到他們是誰，並在聽到警報之前，蒙古軍隊正若無其事地漫步在城鎮的門口。
出人意料地從沙漠中出現之後，成吉思汗並沒有立即行進，並趁勢攻擊布哈拉，他知道，沒有援軍能離開正被他的部隊所進攻的邊境城市，因此，他可從容地運用一種令人痛苦的方式，左右布哈拉民衆的憂慮和希望，這種策略的目標很簡單而又往往是相同的：在戰鬥真正開始之前，用恐嚇手段迫使敵人投降，起先通過奪取鄰近的幾個小城鎮，成吉思汗的部隊釋放了很多當地的平民逃往布哈拉，逃亡者不僅充斥該城，而且大大地加劇了城內的恐懼氛圍，蒙古人在敵軍防線背後的侵襲，立即給整個帝國帶來了巨大的破壞和恐慌。
正如波斯編年史家阿塔篾力克·志費尼所描述的那樣，當人們看到環繞在他們周圍的鄉下居民時，他們“被騎兵和騎兵帶來的暗如黑夜的灰塵窒息住了，驚嚇和恐慌壓倒了他們，而且擔憂和恐懼盛行。”成吉思汗從給予民衆兩種選擇開始，着手準備對一座城市展開心理攻勢，他給城外的民衆提供寬待的投誠條款，若他們接受條款就可加入到偉大仁慈的蒙古人之中。
用波斯編年史家志費尼的話來說，“無論誰屈從於他們都可獲得安全和自由，並遠離嚴酷的恐怖與恥辱。”對那些拒絕接受苛刻條款的俘虜，蒙古人就會在下一次進攻中，將他們置於軍前，充當戰爭的炮灰。
進攻被設計成一次勢不可擋的兵力展示，觀衆不是布哈拉已被征服的民衆，而是遠方的軍隊和成吉思汗下一個目標城市——撒馬爾罕的民衆，蒙古入侵者展示了他們新造的圍攻武器——弩炮、投石機，這些器械作爲武器，已被圍攻部隊使用了幾個世紀，它們不僅能投擲出石頭和火焰，還能射出燃燒的液體、爆炸裝置和燃燒物質，他們調來了裝在輪子上的巨大弩炮，而大隊大隊的人馬則帶着可伸縮雲梯攻上塔樓，從塔樓那裏，他們能夠擊中內城中的守軍。
從城市上空進行攻擊的同時，坑道工兵們開始在牆底挖地道，在展示空中、地面和地下令人生畏的技術威力的同時，某些情況下，成吉思汗還逼迫已被俘的內堡守軍的同伴去攻城，有些囚犯衝鋒在前，屍積城壕，有些則推着武器活着衝入到城堡之內，通過這種方式，成吉思汗加劇了守軍的心理緊張。
蒙古人從曾經接觸過的不同文化中吸收經驗，發明和使用各式武器;而且通過這種知識的積累，他們還創立了全球性的武器庫，能夠適應所遭遇到的任何形勢，蒙古人試驗成功了會噴火或爆炸的武器，這些武器後來變成爲迫擊炮和加農炮，在志費尼的描述中，我們對其準確講述他們周圍發生過什麼的證據感到困惑，他將蒙古人的進攻描寫成“就像熾熱的火爐吸收了堅硬的木頭，火勢更盛，從爐腰將火花射向空中。”成吉思汗軍隊將草原勇士所具有的兇猛與速度，和中華文明的最高科技智慧結合在一起。
成吉思汗使用快速機動並訓練有素的騎兵去對付地面上的敵軍步兵，而通過使用新型的火力轟擊技術和空前的破壞器械，則減弱了內堡城牆的防護威力，使蒙古軍隊得以突破要塞，從而脅迫城堡守軍。隨着炮火和死神紛紛降落到城堡內的守軍身上，用志費尼的話來說，算端的勇士很快便“淹沒在完全毀滅的汪洋大海中。”
成吉思汗認識到，戰爭不是一場身體的比賽，或僅僅是對手間的競爭，它是一種人反對另一種人的總體事業，勝利不會傾向於那些按規則行事的人;它垂青於製造規則並將規則強加給敵手的人，勝利不可能是局部的，它是完全的、全部的，而且也是無可否認的——或者什麼都不是。
