康熙一直被史學界和國人認爲是中國歷史上的一個仁君，但跟絕大多數皇帝一樣，康熙的執政也不是完美的，甚至還對老百姓造成了巨大的傷害。網絡盤點“康熙在位時有四大暴行”，深以爲然。
但作爲喜歡讀書寫字的人來說，認爲康熙犯下的最大罪孽還是“文字獄”。“言說”是天賦於人的本能，也是天賦於人的基本權利，但霸道、虛僞的統治者往往“防民之口甚於防川”，讓人因言獲罪。封你的口，接着就殺你的頭。下面看看康熙時期很著名很惡劣的的文字獄事件。
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康熙統治下發生的戴名世之獄，也稱《南山集》案。戴名世僅僅因爲贊同方孝標給南明正名的觀點，結果就被斬首，家人好友等也被牽連爲奴。這個案件廣爲人知，對於製造這樣文字獄的皇帝，不譴責其暴虐還稱頌其爲仁愛?
康熙時期還有一件舉世聞名的文字獄“朱方旦案”。在《清代禁書總述》一書內的《清代文字獄紀略》也有對此案的介紹：“朱方旦之獄——康熙十九年(1680年)，湖廣有朱方旦者，自號二眉山人，聚徒橫議，撰《中說補》，謂中道在兩眉間山根上，……康熙二十年(1681年)七月，侍講王鴻緒得方旦所刻《中質祕書》，指摘其中有誣枉君上，悖逆聖道，蠱惑民心之處，次年二月，九卿議復‘乞正典刑，以維世道’。結果朱方旦被斬，弟子陸光旭、翟鳳彩、顧齊宏亦被判爲斬監秋後處決”。
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當時侍講王鴻緒所參朱方旦三大罪：一則談傳教信仰，具出世法，略去帝王臣庶之階級也;二則信徒之多也;三則發明記憶在腦不在心，以爲立說新異也。
前兩條的話，那估計明代的王艮甚至王陽明在康熙統治下都免不了被殺頭的命運，王艮不必說了，出身鹽丁的平民思想家，狂妄自大，以聖人自居，門徒無數，僅僅這就足夠在他在清朝康熙統治下被殺頭了，至於王陽明，那光他說“學，天下之公學也，非朱子可得而私也，非孔子可得而私也。”在康熙統治下，得一個離經叛道的罪名不在話下，更何況他也是聚徒講學，轟動四方，被門徒擁戴成聖人。
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如果論最後一條“記憶在腦不在心，以爲立說新異也”，這其實也是康熙和他的大臣無知，這個觀點其實並不新鮮，早在明末許多知識分子那裏就已經流傳開來了，怎麼到了他這裏變成立說新異，以至成爲殺頭的罪名?清末民初史學大家孟森寫過一篇《朱方旦案》時這麼說：所謂新發明之腦力作用，尤爲生理之定義，學界之雅言，略以爲大罪，則今日之書籍皆當焚禁，學校皆當封毀矣。
