張居正(1525-1582年)，字叔大，號太嶽，明代著名的政治家、改革家，身爲隆慶、萬曆兩代帝師，於隆慶元年二月入閣參贊機務，進入大明王朝的政治中樞，至隆慶六年官拜內閣首輔，由此掀開了長達十年之久的萬曆新政，使瀕臨崩潰的大明王朝，在短期內呈現中興氣象。他生前建立了輝煌功績，與商鞅、王安石並稱爲我國封建社會時期的三大改革家。
但是，張居正死後不到一年，卻被抄了家，大兒子被逼自殺，家人被髮配到邊疆。究竟是什麼原因使得萬曆皇帝對屍骨未寒的張居正進行如此清算?
經過分析，其主要原因有四方面。
第一、君臣之間權利爭奪的必然結果
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萬曆皇帝初登皇位時，母慈子弱，太后和小皇帝需要強有力的人物來支撐朝局，輔佐年幼的皇帝處理國家政事，因此小皇帝母子對張居正尊崇備至、言聽計從，並且張居正的新政卓有成效的。在近十年的輔政過程中，張居正事無鉅細、無論政事還是皇帝的私生活，他都要加以嚴加管束、干涉，甚至還訓斥、責罵犯錯的小皇帝，似乎忘記了他們之間還存在着君臣的界線。
萬曆皇帝一天天長大、成熟，逐漸向皇帝角色轉換，皇帝尊嚴和權力不容下臣侵犯和剝奪。而張居正把持朝政，作威作福，甚至對小皇帝的宮闈生活也要說三道四，這使得萬曆對張居正的態度由尊崇備至轉變爲暗懷嫉恨。權高震主，是歷朝歷代爲臣子的大忌，而張居正不懂韜晦、不知收斂，依然故我，大包大攬，視皇帝如懵懂不知的幼童。殊不知，此時皇帝心靈深處的仇恨正慢慢發芽、生根。張居正生前，萬曆皇帝無法撼動他的權威，但所有的積怨都在他死後爆發了。抄家、兒子自殺、家人發配邊疆……，這些人禍全都降臨到張居正的家族身上了，由其家人來承受這些飛來橫禍。我們設想：假若張居正不死，親政後的萬曆皇帝遲早也會奪回屬於自己的權力的，君權神聖不可侵犯。因此，張居正的被清算和家族的滅門之災是君臣之間權力爭奪的必然結果，也使得萬曆皇帝樹立起了自己的權威。
第二、長期受壓制的政敵以及在改革中利益受損的官僚集團的反攻倒算
樹倒猢猻散，牆倒衆人推。萬曆十年六月，張居正一死，長期受到壓制的政敵以及因改革而利益受損的官僚集團聯合起來，發起了猛烈的“清算風”，彈劾的奏章如雪片般飛到了萬曆皇帝的御案上，彈劾他結黨營私、奢侈淫逸、口是心非。一向對張居正敬重、信賴的萬曆和慈聖太后完全沒有意料到。尤其是萬曆，精神上受到了無情的打擊，他視作依靠，並尊重備至的張居正，背地裏竟然會是這樣一幅齷齪的面目;他痛感皇帝的人格受到愚弄，天子的威嚴遭到侵犯，由此開始一場長達兩年的清算張居正運動。張居正生前的一切榮耀被剝奪，親信遭受清洗，家產被抄沒，大兒子被逼死，家人被充軍邊疆。這次清算，萬曆和太后固然是發泄了私憤、洗去了恥辱，可是對於國家卻不是什麼好兆頭，它結束了隆慶、萬曆初年的改革，使稍有起色的明朝又重新步入不可挽回的衰敗境地。
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第三、萬曆皇帝貪財好利，也是推動清算的重要原因
萬曆的生母李太后出身於小商販之家，貪財好利，潛移默化地萬曆皇帝也繼承了他生母李太后的這一個惡習。他常在宮內外搜尋一些珍奇玩物，來充實自己的小金庫;收取大臣的賄賂，碰到奇珍異寶就明爭暗奪，佔爲己有。萬曆皇帝總感到自己貴爲天子，富有四海，可是花起錢來卻不能爲所欲爲。當時，萬曆的同母弟弟潞王已年滿十六歲，面臨着婚娶了，可操辦婚禮的銀子無法籌齊，李太后十分煩心。正好這時候，雲南道御史羊可立上了一道“已故大學士張居正隱佔廢遼府第田，乞嚴行查勘”的疏奏，已廢遼王次妃王氏也奏稱遼王府“金寶萬計，悉入居正府”，都說得有根有據。再加上馮保抄家，所得鉅萬，貪財好利的萬曆皇帝好不動心。至此，張居正家族厄運難逃。此次抄家一共抄得黃金一萬餘兩，白銀十幾萬兩。
第四、一人獨大，後繼無人，致使死後無人幫襯。
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張居正生前不注重培養人才，改革的千斤重擔無人承擔，自己的衣鉢無人繼承，也是他如此迅速而徹底敗亡的一個原因。張居正有着致命的缺點：剛愎自用，偏信偏聽，喜歡阿諛奉承之徒，打擊直言敢諫之士。臨到萬曆皇帝向張居正清算的時候，朝臣們一呼百應，奮勇爭先，卻沒有人敢替他說話，替他伸冤。相反，那些受他提拔、被他重用的新政人物，爲了撇清關係反倒成了清算張居正的急先鋒。對比而言，晚晴的中興名臣曾國藩就棋高一着!生前着力培養自己的繼承人，將自己的衣鉢全部傳於學生李鴻章;李鴻章不僅獨力支撐起搖搖欲墜的大清王朝，延緩了清朝滅亡的步伐，而且其終生都視曾國藩爲恩師，極力維護其聲譽和名望，曾國藩可算是封建時代功成身退的絕佳例子。
萬曆皇帝對首輔重臣張居正的清算，致使厲行十年的萬曆改革戛然而止。而歷經兩百年風雨的大明王朝，在六十年後，被農民起義軍的浪潮衝擊得土崩瓦解，最終，明朝末代皇帝崇禎走投無路、吊死在煤山!
