在明朝晚期，宮廷中發生了三件疑案，這三個案子不大不小，影響也沒有那麼嚴重，之所以把它們併爲“明朝三大案”，是因爲它們是標誌着明朝紛亂衰亡的開始。
萬曆皇帝朱翊鈞
1.梃擊案
明朝萬曆年間，萬曆皇帝曾28年不上朝，因立太子之事和朝廷爭執長達十餘年。萬曆帝的長子朱常洛是太后宮女王氏所生，他對這個兒子可謂是冷漠至極，一點也不喜歡，他最喜歡的是寵妃鄭貴妃所生的三皇子朱常洵，因此，萬曆帝常常悄悄和鄭貴妃約定要立他們的兒子爲太子，將來繼承皇位。
古代皇帝確立繼承人應當是嫡子爲先，無嫡立長，按照這個規矩，朱常洛纔是太子的唯一人選，但是萬曆帝屢屢拖延，直到皇太后施壓，才於萬曆29年(1601年)冊立朱常洛爲皇太子，同時也封常洵爲福王，藩國洛陽。太子冊立後，又持續鬥爭了13年，直到萬曆42年，朱常洵離開京城前往洛陽，才真正確立了朱常洛的太子地位。
泰昌皇帝朱常洛
萬曆四十三年五月初四(1615年5月30日)瘋漢張差從宮外一直闖入太子宮，持棍亂打太子朱常洛，驚動朝廷。萬曆四十一年(1613年)，鄭貴妃內侍曾與奸人勾結詛咒皇太子朱常洛，想必梃擊案她也逃不了關係。
如果不是有意而爲，一個宮外男子如何能順利進入守衛森嚴的皇宮毆打太子。不過，萬曆帝不願“殃及他人”，最終以張差死而告終，梃擊疑案糊塗了結。
朱常洛
2.紅丸案
朱常洛自幼不得其父喜愛，13歲纔出閣讀書，又長期輟讀，經歷坎坷。朱常洛(泰昌帝)即位後，心機深沉的鄭貴妃又竭力籠絡他的寵妃李選侍，二人謀合，欲爲己請封皇太后和皇后之號。由於憂心國事，本已虛弱的身體，不幾日更是“聖容頓減”，“病體由是大劇”。
崔文升進宮爲皇帝看病，由於他曾經是鄭貴妃的內侍，所以遭到東林的攻擊，他們說皇帝得病是因爲縱慾過度，崔文升是受鄭貴妃指使，想要下毒謀害皇帝，這令衆太醫都不敢給皇帝治病，一個皇帝做到這份兒上也是憋屈不已。
圖據網絡
不久後，鴻臚寺丞李可灼自稱有仙丹妙藥可治帝疾，大臣們雖然勸皇帝不要吃，但是朱常洛此時也沒有別的辦法了，權當是死馬當作活馬醫。初服一丸，四肢和暖，思進飲食，再進一丸，於次日凌晨即崩。此藥爲紅色，稱“紅丸”，以鉛爲主，以蔘茸爲副。
於是東林展開攻擊，稱鄭家有意謀害皇帝。繼朱常洛而後新登基的天啓皇帝朱由校迫於輿論壓力，准許內閣首輔方從哲退休，將崔文升發配南京，李可灼充軍，此案草草收場。最後調查結果稱在場“衆臣皆有罪”。
圖據網絡
3.移宮案
朱常洛自幼不受萬曆皇帝的喜愛，朱由校也是如此，直到萬曆帝臨死的時候，纔將他立爲皇太孫。朱由校的母親王才人雖然地位高於李選侍，但奈何李選侍受寵，王才人被李選侍凌辱至死，臨終前遺言：“我與西李有仇，負恨難伸”。
朱常洛即位後，朱由校與李選侍一起遷住乾清宮。一月後，朱常洛駕崩，李選侍控制了乾清宮，在太監李進忠(魏忠賢)等支持下，企圖逼封皇太后。駕崩當日，楊漣、劉一燝等朝臣直奔乾清宮，要求哭臨泰昌帝，請見皇長子朱由校，商談即位之事，但受到李選侍的阻攔。在大臣們的力爭下，李選侍方準朱由校與大臣們見面。
天啓皇帝朱由校
大臣們保護朱由校離開，李選侍挾持朱由校的目的落空，又提出凡大臣章奏，先交由她過目，然後再交朱由校，朝臣們強烈反對。朝臣們要求李選侍移出乾清宮，遷居噦鸞宮，遭李選侍拒絕。
朱由校的東宮伴讀太監王安在乾清宮內力驅，李選侍萬般無奈，懷抱所生八公主，倉促離開乾清宮，移居仁壽宮內的噦鸞宮。九月六日，朱由校御奉天門，即皇帝位，改明年爲天啓元年。至此，李選侍爭當皇太后、把持朝政的企圖終成化影。
移宮案和紅丸案、梃擊案並稱“明末三案”。
