關於順治皇帝臨終傳位問題，直到現在還被人們質疑，從記載中可以看出，康熙帝玄燁在順治生前並不受寵。而最讓人信服的無非就是玄燁曾經出過天花，而得以繼承皇位。
然而分析順治和孝莊太后的母子關係卻不難發現，這對母子在感情上不甚和睦，順治處處受到母后孝莊的牽制，作爲20多歲的皇帝，天生叛逆也情有可原。關於順治帝嗣君的選定，魏特在《湯若望傳》中披露一些內幕。
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書中稱道：順治帝在病重期間，沒有立詔傳位皇子，而是想從他的兄弟中選擇一位繼承。皇帝詢問湯若望等人的意見，湯若望完全站在了孝莊太后的一邊，支持皇太后所選的皇子作爲繼承人，於是順治帝才決定玄燁爲帝位繼承人，促成這個決斷的理由就是這位年幼的皇子已經出過天花，今後不會再受到這種病症的傷害。而那些年齡較長的皇子，尚未出過天花，時時得小心這種可怕恐怖的病症。
記載中談到了順治先是選中了一位“從兄弟”，當時還在世的“從兄弟”有四位，分別是輔國公葉布舒、鎮國公高塞、輔國公常舒和輔國公韜塞，雖然不知順治到底選中了那一位，但很明顯，這四位都是滿籍妃嬪所生，沒有一人出自蒙古的博爾濟吉特氏。
順治這種做法很明顯違背了“子承父繼”的祖制，他自己繼位的時候應該最有體會，倘若不是這個祖制的約束，他的皇位可能就是多爾袞的。明知如此，順治帝還有意爲之，顯然是用意的。
這種立兄弟爲嗣的做法孝莊太后是絕對不會允許的，她不僅在兒子病危時“力促”選立嗣君，而且召集親王們共同推翻皇帝的成命，力主在皇子中選立新帝。
關於母子之間議立新帝的分歧經過，比較合理的解釋是，順治帝初二臥病不起，自知不久於人世，便召見王熙議立繼位之君等事。他即與母后有隙，於是提出了“從兄弟”即位作爲報復和最後的抗爭，並寫有“密封奏摺”。
王熙不過是一介小小漢官，怎敢在如此重大事情上擅自隱諱，便向孝莊太后如實稟告。太后聞訊後五內俱焚，立即召集諸親王會議，堅決反對順治皇帝的成命。
順治帝共有八子，其中四個早夭，當時除了玄燁外尚有福全、常寧和隆禧，俱非蒙古妃子所生。孝莊皇太后因皇后無子，只能從帝業穩定的角度考慮，提出讓已經出過天花的玄燁即位。
面對母后的建議，順治無奈，只得勉強答應，也可能最終雙方未達成協議，但是他已經黃泉路近，緊接着便出現了孝莊太后私改遺詔之事。
初六日，大學士王熙再次被召入宮，順治帝自覺病勢沉重，恐再難支，他強撐病體，對王熙囑道：“朕患痘，勢將不起，爾可詳聽朕言，速撰詔書，即就榻前書寫。”
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王熙聞言淚流滿面，泣不成聲，順治帝催促道：“朕平日待爾如何，訓爾如何詳切，今事已至此，皆有定數。君臣遇見合，緣盡則離，爾不必如此悲痛。此何時，尚可遷延從事，致誤大事?”順治帝直到臨終還是想把皇位傳給他的兄弟。
王熙只得拭淚吞聲，在御榻前執筆撰詔，但他心中暗暗叫苦，未曾料到順治皇帝特令“就榻前書寫”，一刻不離，這着實難辦。
原來被順治帝視爲心腹的王熙，早已置於孝莊太后的控制之下，他與皇帝的所有言談舉止，太后悉之無遺。此刻的王熙即知道順治帝的秉性固執，更懼怕太后的權勢威嚴，而遺詔一經擬定蓋上玉璽，就很難更改一字，那麼在孝莊太后面前他也無法交代。
想到這兒，王熙進退維谷，左右思量，當寫完第一段遺詔之後，他發現順治已倦容滿面，不由心生一計，忙奏道：“恐過勞聖體，容臣奉過面諭，詳細擬就進呈。”順治帝已經氣息奄奄，再無精力去想王熙此話背後的真實意圖，便將遺詔大意說明，王熙忙捲起詔書，退出寢宮，方纔脫身。
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王熙連夜擬詔，反覆修改到第二天中午纔算定稿。然後交給順治帝御覽，可是此時的順治帝已經絲毫沒有精力細看，當天夜裏順治帝便去世了。
孝莊太后從容不迫的按照自己的意思修改遺詔，玄燁最終登基即位完全是孝莊太后的功勞。
不過這段歷史也只是很多學者的推斷，但玄燁即位的結果是好的，孝莊此舉不但成就了一位明君帝王，更是成就了一番祖孫千古佳話。
