盧卡雅戰役之後，坦桑尼亞聯軍一路向西進逼坎帕拉，途中幾乎沒有遇到什麼抵抗。至3月底，烏干達軍隊已經瀕臨徹底崩潰的邊緣，而駐紮在恩德培的利比亞軍隊也苦陷於坦軍的重圍中。卡扎菲不忍心失敗，還於4月1日派遣了一架圖一22B轟炸機投下大量炸彈意圖轟炸坦軍，但是卻沒有一枚炸彈擊中目標。與之相比較，坦桑尼亞空軍連續多天出動殲一6和殲一7戰機，轟炸坎帕拉、金賈、託羅羅等戰略城市，基本上消滅了烏干達軍隊和利比亞軍隊的有生力量。坦桑尼亞聯軍一舉拿下了恩德培。
連續的轟炸使坎帕拉的平民紛紛逃離，50萬人的大城市頓成空城。3月27日，阿明已經倉皇逃離了坎帕拉，直奔烏干達第二大城市金賈。4月10日，坦桑尼亞聯軍攻佔坎帕拉，在坎帕拉，也只是遇到零星抵抗。烏坦戰爭最終以坦桑尼亞的徹底勝利告終。
利比亞軍隊在失敗後撤退到金賈，聯軍佔領金賈后，利比亞軍隊被遣返，途徑肯尼亞和埃塞俄比亞，回到利比亞;至於伊迪·阿明——烏干達前總統，被迫流亡海外，他帶着四個妻子、數名情婦、以及20多名子女逃亡到利比亞開始其流亡生活，由於他的保安跟當地警察發生衝突，阿明被迫離開，先短暫至伊拉克，及後定居在沙特阿拉伯。
坦桑尼亞軍隊在戰爭結束後繼續駐留在烏干達，一直到烏干達組織民主選舉，國家程序恢復正常爲止。
