1644年，是中國歷史上天翻地覆的一年，就在這一年清軍入主中原，無數漢人的噩夢就此開始。清軍入住中原後，強迫漢人剃髮易服，這對於漢人來說以一種莫大的侮辱，各地人民紛紛起義反抗清朝，清朝對此採取屠城政策來強行推行“剃髮易服”政策，於是乎一場場慘無人道大屠殺在中華大地上輪番上演。
畿南之屠
順治元年(1644年)五月，清朝睿親王多爾袞在北直隸三河、昌平、良鄉等地進行的屠城，五千人被殘殺。
潼關之屠
順治元年(1644年)正月十三日，清朝“豫親王”多鐸在陝西潼關地進行的屠城，七千人被殘殺。
揚州十日
順治二年、南明弘光元年(1645年5月20日)。清軍攻破揚州，開始屠殺城內的平民百姓。史載：“諸婦女長索繫頸，累累如貫珠，一步一跌，遍身泥土;滿地皆嬰兒，或襯馬蹄，或藉人足，肝腦塗地，泣聲盈野。”“初四日，天始霽。道路積屍既經積雨暴漲，而青皮如蒙鼓，血肉內潰。穢臭逼人，復經日炙，其氣愈甚。前後左右，處處焚灼。室中氤氳，結成如霧，腥聞百里。”後來由城內僧人收殮的屍體就超過了八十萬具。
嘉定三屠
順治二年、南明弘光元年(1645年)在清軍攻破嘉定後，清軍將領李成棟三次下令對城中平民進行大屠殺。在屠城過程中，城中百姓或者懸樑自殺或者投井和跳河，被砍斷手和腳的百姓在地上掙扎着。清軍將一大部分逃生的百姓趕到河邊，然後將他們趕進河中紛紛淹死，河裏的水都不能流動了。
崑山之屠
順治二年、南明弘光元年(1645年)崑山縣人民殺該縣清委知縣閻茂才，起兵反清。七月初六，清軍破城，隨即屠城，士民死難者達數萬人。清軍屠崑山的時候，有婦女千人藏匿在崑山頂上。有個小孩忍不住哭出聲來，被清軍發現，於是大肆屠殺這些婦女。
嘉興之屠
順治二年、南明弘光元年(1645年)閏六月二十六日，浙江布政使司隸嘉興府爲反抗清軍暴行，嘉興民衆揭竿而起，鄉的明翰林學士屠象美、明兵科給事中李毓新主其事，時降清的明嘉興總兵陳梧反時任大將軍指揮義師，前吏部郎中錢棅助餉。二十六日城陷，逃不出的居民除大批年輕婦女被清軍擄掠和一些僧人倖免外，幾乎全遭屠殺。按當時人口來推，可能約五十萬餘人遇難。
江陰八十一日
順治二年、南明弘光元年(1645年)清朝頒佈剃髮令後，江陰人民舉行了反清起義，進行反清鬥爭。清廷先後調動24萬軍隊攻城，江陰人民浴血奮戰，守城八十一天，擊斃清三王十八將，清軍死傷過十萬。但終因力量懸殊，糧食罄盡，守城者全部壯烈犧牲。城破後遭到清軍血腥屠殺，繁華的街市盡爲廢墟。
四川大屠殺
從順治三年(1646年)至康熙初期，清軍開始侵入四川，在四川各地進行大屠殺。順治四年(1647年)多爾袞、孝莊採取了徹底屠殺的辦法作爲報復，公開發佈告示，宣稱：民賊相混，玉石難分，或屠全城，或屠男而留女。前後十多年裏共有500多萬人被清軍屠殺。
常熟之屠
順治二年、南明弘光元年(1645年)八月到九月，清軍先後佔領蘇州和南直隸常熟之後的縱兵焚燒殺掠。在常熟大屠殺中被屠殺的百姓無法計算，沿河沿岸都是人頭。
金華之屠
順治三年、南明隆武二年(1646年)七月十六日，清朝“貝勒”博洛在攻佔浙江金華府進行的開始大規模屠城。大約有五萬人被屠殺。
涇縣之屠
順治三年、南明隆武二年(1646年)八月十七日，清朝“提督”張天祿、“池州總兵”於永綬在南直隸涇縣、徽州、績溪縣等地進行的一次大規模屠城。大約有五萬人被屠殺。
贛州之屠
順治三年、南明隆武二年(1646年)十月初四日，清朝“江西提督”金聲桓、“總兵”柯永盛在江西贛州府進行的一次大規模屠城。大約有二十萬人被屠殺。
同安之屠
順治四年(1647年)清軍攻克福建廈門和同安縣，然後屠城。福建同安縣屠城死難5萬餘人，梵天寺住持無疑和尚收屍合葬於寺東北一里之地，建亭“無祠亭”，墓碑上則刻“萬善同歸所”。
平海之屠
順治四年、南明永曆元年(1647年)七月，清軍在福建平海衛進行大規模屠城。被屠殺的無辜百姓具體人數不詳。
南昌之屠
順治五年(1648年)清軍包圍南昌。次年三月間，南昌城陷，清軍屠城。八旗軍把從南昌掠來的婦女分給各營，晝夜不停的輪姦。不久之後南昌被起義軍奪了回來，但在順治六年(1649年)清軍再次佔領江西南昌，下令進行屠殺。
邵武之屠
順治五年、南明永曆二年(1648年)五月，清朝“福建左路總兵”王之綱在福建邵武縣進行屠城，被屠殺的無辜百姓人數不詳。
湘潭之屠
順治六年(1649年)正月二十一日清軍攻入湖南湘潭和沅州(今芷江)，南明督師何騰蛟被俘。清鄭親王濟爾哈朗下令在湘潭屠城，湘潭城中百姓幾乎全被殺光，城中不滿百人。
同安之屠
順治五年、南明永曆二年(1648年)八月十六日，清朝“靖南將軍”陳泰、“浙閩總督”陳錦、“福建提督”趙國祚在福建同安縣進行大屠殺，大約有五萬人被屠殺。
南雄之屠
順治六年(1649年)農曆十二月二十九日，清軍抵達南雄，年三十除夕晚上清軍放火焚燒鼓樓，趁明軍慌亂救火之際，攻入城內。對南雄縣民大肆屠殺，“大清平、靖二藩克雄城，民盡屠戮，十存二三。
信豐之屠
順治六年、南明永曆三年(1649年)三月初一日，清朝“梅勒章京”膠商攻克廣東信豐縣，進行大規模屠城。
蒲城之屠
順治六年、南明永曆三年(1649年)四月初五日，清朝“固山額真”李國翰攻克陝西蒲城縣然後進行大規模屠城。大約有一萬人被屠殺。
曹州之屠
順治六年、南明永曆三年(1649年)十月初四日，清朝梅勒章京賴惱、沂州總兵佟養量、臨清總兵宜永貴等攻克山東州曹州，進行屠城。被屠殺的無辜居民人數不詳。
汾州之屠
順治六年、南明永曆三年(1649年)九月至十一月，清朝“端重親王”博洛、“和碩親王”滿達海等在山西汾州、太谷縣、泌州、澤州等地進行規模屠城。大約有四十萬人被屠殺。
大同之屠
順治六年(1649年)清軍在大同屠殺後，全城只剩下5個重案犯。清朝派來的大同知府，上書順治帝，稱既然沒有了苦主，就可以釋放這5個人了。這份奏摺，至今保存在第一歷史檔案館。
廣州大屠殺
順治七年(1650年)尚可喜打帶領清軍清軍攻廣州，圍城十個多月後廣州城破。清軍入城之後開始屠城，史書記載： ”可喜屠廣州，孑遺無留;逸出城者，擠之海中。“ 死難十萬至七十萬人。
潮州之屠
順治十年(1653年)清軍佔領廣東的潮州和南雄，清軍之後進行下令屠殺，“縱兵屠掠，遺骸十餘萬”，“癸巳，郡城破，橫屍遍野……收遺骸十餘萬，作普同塔於葫蘆山”。
揭陽縣觀音堂海德和尚等收屍聚焚於西湖山，將骨灰葬在西湖南巖。福建同安縣屠城死難五萬餘人，梵天寺主持釋無疑收屍合葬於寺東北一里之地，建亭“無祠亭“，墓碑上則刻“萬善同歸所”。南雄縣民也遭到大肆屠殺，“大清平、靖二藩克雄城，民盡屠戮，十存二三。”
“家家燕子巢空林，伏屍如山莽充斥……死者無頭生被擄，有頭還與無頭伍。血泚焦土掩紅顏，孤孩尚探娘懷乳。”
永昌之屠
順治十六年、南明永曆十三年(1659年)閏三月，清朝“徵南將軍”趙布泰、“提督”線國安等在雲南永昌府等地進行的一次大規模屠城。
經過清軍的大屠殺後，明朝年間有5000多萬人，到來清朝康熙年間只剩1063萬，少了2000萬人。這其中雖然也有死於瘟疫和明朝內戰的，但大部分還是還是被清軍所殺。
