朱允炆如果不跑，就在皇宮裏面等朱棣到來，最後的結果只能是朱允炆被朱棣羞辱一番，然後再被殺。
朱允炆不死，朱棣便不能名正言順的做皇帝，隨之和朱棣一起謀反的臣子便不能獲得晉升。要知道朱棣起兵反叛時，打起的旗號可是靖難。這一旗號便說明朱棣是以清君側的名義而起的兵。朱允炆被俘後，朱棣不會馬上殺了他，而是會先行除掉朱允炆麾下所謂的奸臣，隨後朱棣會將朱允炆貶爲昏庸侯或是平民。等到大局穩定時，朱允炆纔會突然“暴斃而亡”。
朱棣殺死朱允炆既能讓自己的繼位，變得合理合法，又能穩定大局，何樂而不爲呢?從朱棣派出多路人馬，苦苦搜尋朱允炆的下落便可知，不除掉朱允炆朱棣是寢食難安的。身在其中的朱允炆也深知這一點，自己落到朱棣的手上不會有好結果，所以他纔會借一場大火逃離南京城，從此過上隱姓埋名的生活。
至於朱棣非殺朱允炆不可，是基於以下幾點原因。
一、朱允炆在位期間，雖然曾暴力削除藩王，但推崇儒家治國的他，卻對民間廣施仁政。隨之追隨朱允炆的文官有很多，民間百姓也覺得朱允炆是心目中理想的仁君。百官和百姓都擁戴朱允炆，這對繼位後準備一展抱負的朱棣可不是什麼好事。一旦放過朱允炆，朱允炆很可能會利用皇帝的名望復辟，到時朱棣能怎麼辦?到時朱棣還是要殺掉朱允炆。既然朱棣早晚都要揹負罵名，何不盡早除去朱允炆呢?
二、朱元璋所立的聖旨，指定了朱允炆爲大明江山的繼承人。這就是說朱允炆是皇位正統的繼承人，朱棣即使有再多借口，他也是個篡位者。朱棣可以更改史書，但人們口中的篡位者，朱棣是無法抹滅的。朱棣只有用朱允炆的死，才能換來自己繼位的正統性。所以說朱允炆不逃，必然會被朱棣殺掉。
三、大明天下不能有兩個皇帝，哪怕是一個被廢除了皇位的皇帝也不行。即使朱允炆被貶爲昏庸侯或是平民，朱棣也不可能讓他長時間活着。這是因爲天下初定，如果元蒙殘部得到朱允炆，並利用朱允炆曾經的身份進攻中原，那就將給大明江山帶來大亂。這也是朱棣爲何先後派出鄭和、胡濙等人尋找朱允炆下落的原因。朱允炆必須死在朱棣手上。沒死在朱棣手上也要活見人死見屍。
朱棣多次率軍討伐元蒙的原因，很可能也是爲了防備朱允炆逃去蒙古。因爲朱棣要爲自己和子孫留下一個沒有隱患的江山。
公元1423年，已經64歲的朱棣，將走了到生命的盡頭。就在朱棣率兵征伐蒙古的某晚，侍衛叫醒了熟睡中的朱棣。正準備對侍衛發火的朱棣，得到了侍衛的稟報：胡濙求見。本來準備大發雷霆的朱棣，在聽到胡濙的名字後霍然起身，隨即朱棣便命胡濙趕快入帳進見。
《明史》對朱棣接見胡濙的記載爲：當時的朱棣已經就寢，在聽聞胡濙求見自己的消息時，朱棣立即起身召見。當時營中剛剛敲過四更鼓。胡濙入帳後向朱棣彙報：傳言朱允炆已經遠赴海外。得到這一消息的朱棣，立即派出數名內侍(包括鄭和)遠赴海外搜尋朱允炆的下落。後來朱棣派出的一路人馬，向他彙報了一個消息，朱棣這纔打消了疑慮，釋然而終。
一、朱允炆已死，胡濙找到了他的屍骨，並確定了朱允炆的死訊。
二、某路人馬找到了朱允炆，將其滅口，幫助朱棣永絕後患。
三、朱允炆(做起了和尚)沒有死，而是通過交談，向胡濙表明自己已經放棄了皇位。
胡濙的彙報正是告訴朱棣，朱允炆已經不再是你的隱患了。隨即年老的朱棣，這才釋懷，目前大多數史學家比較認同第三種觀點。綜上所述可以看出，剛奪取皇位時的朱棣，並不想就此放過朱允炆，他對朱允炆充滿了殺意。爲了儘早除去朱允炆，朱棣不惜派出大量人馬，耗費大量錢財。朱允炆不逃，在皇宮中等着朱棣到來，到時朱棣不殺他會得到什麼樣的結果呢?朱棣死後，被文官和百姓所擁戴的朱允炆，很可能會推翻朱高熾，朱瞻基的統治。爲了不給子孫留下隱患，這樣的朱允炆也一定是留不得的。朱棣不會對朱允炆念及親情，他會盡早除去自己的侄子。
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