侯安都出生於一個富裕的家族，在年輕時展現出博學多才的才華，不僅精通武藝，還被鄉里視爲雄豪之人。後來，始興內史蕭子範徵辟他爲主簿。隨後，他跟隨陳武帝平定了侯景之亂，參與襲擊王僧辯，多次擊退北齊軍隊，爲陳武帝建立了陳朝做出了貢獻。他被任命爲鎮西將軍、南豫州刺史，並封爲西江縣公。
陳武帝去世後，侯安都支持陳文帝登基，並平定了王琳的叛亂。他被提升爲司空，並晉升爲清遠郡公，後來改封爲桂陽郡公，並因平定留異之功被加封爲侍中、徵北大將軍。
自從平定了王琳之後，侯安都自視功勞卓著，大肆招募文武之士，組織騎射訓練，評判詩文，並邀請褚玠、馬樞、陰鏗、蕭摩訶、裴子烈等人爲賓客，家中聚集了成千上萬的人。他的部下將領也大多不守法度，遇到問題就尋求侯安都的庇護。陳文帝對此非常不滿，但侯安都卻沒有悔改的意思，反而越發傲慢。
後來，侯安都陪陳文帝舉行宴會，問道：“現在相比起我當初作臨川王時如何?”陳文帝沒有回答，但侯安都一再追問。無奈之下，陳文帝只能回答道：“這雖然是天命，但多虧了侯公的幫助。”宴會結束後，侯安都還向皇帝借用供帳水飾，打算在殿堂上與妻妾聚會。儘管陳文帝答應了他的請求，但內心並不高興。第二天，侯安都在宮中擺設盛大宴會，自己坐在皇帝的位置上。
早些時候，重雲殿失火，侯安都擅自帶着將士闖入殿內，這讓陳文帝非常不滿，並對他產生了警惕之心。後來，當週迪發動叛亂時，陳文帝不顧朝中大臣的建議，派遣吳明徹前去討伐叛軍，並多次派使者前往侯安都的部下進行巡視和調查。侯安都得知此事後心中不安，於是派遣別駕周弘實去找舍人蔡景歷打聽宮中的消息。蔡景歷將這件事奏告給陳文帝，指稱侯安都謀反。
563年(天嘉四年)，陳文帝任命侯安都爲徵南大將軍、江州刺史，並將他召回建康。同年六月，在嘉德殿上宴請侯安都時，陳文帝在席間將他逮捕，並囚禁在西省，同時將他的部下召集到尚書朝堂，沒收了他們的兵器後釋放，公佈了蔡景歷的奏疏，公開宣佈侯安都的罪狀。次日，侯安都被處決，時年四十四歲。不久之後，陳文帝下詔，命令厚葬侯安都，並寬恕他的家屬。
